15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0946 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0946  PilT domain-containing protein  100 
 
 		 135 aa  280  5.000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000374994  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1454  PilT protein-like  54.48 
 
 		 139 aa  154  3e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1669  PilT protein domain protein  35.61 
 
 		 138 aa  64.7  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.47893  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1751  PilT domain-containing protein  30.53 
 
 		 131 aa  52.4  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0754903  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0232  PilT protein domain protein  33.59 
 
 		 135 aa  50.4  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.363167 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1522  PilT-like protein  32.82 
 
 		 135 aa  48.9  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1884  PilT domain-containing protein  25.37 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000144315  normal  0.966588 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11593  hypothetical protein  30.08 
 
 		 134 aa  48.1  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.69589e-19  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4984  PilT protein domain protein  32.2 
 
 		 139 aa  47.4  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.599937  normal  0.921394 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0280  PilT domain-containing protein  34.43 
 
 		 133 aa  47  0.00009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.4278  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0666  hypothetical protein  32.47 
 
 		 88 aa  42  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.001899  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2254  PilT domain-containing protein  26.98 
 
 		 133 aa  41.2  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.366148  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0589  PilT protein domain protein  27.74 
 
 		 136 aa  41.2  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.663237  normal  0.0136168 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1812  PilT domain-containing protein  25.4 
 
 		 132 aa  40  0.01  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.034692  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0598  PilT domain-containing protein  27.74 
 
 		 136 aa  40  0.01  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0817305  normal  0.249428 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>