78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1812 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1812  PilT domain-containing protein  100 
 
 		 132 aa  273  4e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.034692  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0305  PilT protein domain protein  60 
 
 		 128 aa  172  1.9999999999999998e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0032427  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1840  PilT domain-containing protein  42.74 
 
 		 135 aa  104  4e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1848  PilT protein domain protein  35.77 
 
 		 129 aa  84.3  5e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1337  PilT protein domain protein  39.66 
 
 		 129 aa  78.6  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.1325  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1904  PilT protein domain protein  32.52 
 
 		 129 aa  73.2  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.101114 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2936  PilT domain-containing protein  34.13 
 
 		 130 aa  70.1  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.203821 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1868  PilT domain-containing protein  35.88 
 
 		 133 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000212984  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0898  PilT protein domain protein  33.33 
 
 		 131 aa  61.2  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.185586  normal  0.0272728 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1067  PilT protein domain protein  34.68 
 
 		 134 aa  60.5  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0657  PilT protein domain protein  28.46 
 
 		 129 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2472  virulence associated protein C  33.83 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00148493  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1063  PilT protein domain protein  32.54 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.471234  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2669  PilT protein-like  27.34 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0691561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0478  virulence-associated protein, putative  29.13 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0638  PilT protein domain protein  29.13 
 
 		 136 aa  55.5  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2777  PilT protein domain protein  29.23 
 
 		 134 aa  52.4  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0688  PilT domain-containing protein  31.01 
 
 		 132 aa  52.4  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.442109  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5182  PilT domain-containing protein  29.37 
 
 		 149 aa  52  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.27524  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2505  PilT protein-like  28.03 
 
 		 147 aa  52  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00228638  normal  0.384652 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2332  PilT protein-like  31.34 
 
 		 140 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.221502 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10607  hypothetical protein  27.78 
 
 		 130 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.353151 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3905  PilT domain-containing protein  32.59 
 
 		 134 aa  50.8  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.646522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2617  nucleic acid binding protein  29.23 
 
 		 134 aa  50.4  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.243477 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7721  plasmid stability protein  33.82 
 
 		 140 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.859418 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0414  PilT protein domain protein  28.79 
 
 		 135 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2951  PilT domain-containing protein  29.69 
 
 		 136 aa  50.1  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3558  PilT domain-containing protein  28.8 
 
 		 128 aa  50.1  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0013  PilT protein-like  30.08 
 
 		 140 aa  48.5  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4731  VagD  31.06 
 
 		 138 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.761951  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0038  PilT domain-containing protein  28.68 
 
 		 146 aa  48.5  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1769  hypothetical protein  27.2 
 
 		 131 aa  48.1  0.00004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1788  PilT protein domain protein  29.1 
 
 		 136 aa  48.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.813085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2129  virulence-associated protein, putative  29.1 
 
 		 136 aa  48.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0156283  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2552  PilT domain-containing protein  29.69 
 
 		 152 aa  47.8  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.748536  normal  0.0339823 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0602  PilT protein domain protein  28.35 
 
 		 135 aa  47.8  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.191075  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1433  NtrR protein  27.78 
 
 		 140 aa  47.8  0.00005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3889  PilT domain-containing protein  30.83 
 
 		 142 aa  47.8  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3988  PilT protein domain protein  30.4 
 
 		 133 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0532731 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4028  PilT protein domain protein  30.88 
 
 		 141 aa  47.4  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4764  PilT domain-containing protein  30 
 
 		 138 aa  47.8  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.310304 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0926  hypothetical protein  26.27 
 
 		 207 aa  47.4  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.437058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3767  PilT domain-containing protein  29.84 
 
 		 140 aa  46.2  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.546918  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0630  PilT protein domain protein  28.36 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.317071 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4624  PilT domain-containing protein  28.91 
 
 		 136 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.723585  normal  0.112001 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1362  plasmid stability protein, putative  30.6 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00298137  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3138  PilT protein-like  30.83 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.464533  normal  0.496916 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2719  PilT protein-like  31.82 
 
 		 151 aa  45.1  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.116591 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0018  plasmid stability protein StbB  29.03 
 
 		 139 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0242004  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1780  plasmid stability protein, putative  29.17 
 
 		 139 aa  44.7  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1456  PilT protein domain protein  29.17 
 
 		 139 aa  44.7  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.208651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4437  PilT protein-like  27.48 
 
 		 134 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1325  nucleic acid binding protein  28.46 
 
 		 133 aa  43.9  0.0007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.000000000000354508  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0505  PilT protein domain protein  25.4 
 
 		 131 aa  43.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5055  PilT domain-containing protein  27.2 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0420  PilT protein domain protein  26.72 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0397  PilT protein-like  25.86 
 
 		 123 aa  42.7  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4019  PilT protein-like  30.08 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.506281 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1823  PilT domain-containing protein  30.3 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.402154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1509  PilT domain-containing protein  27.94 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.203613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2302  plasmid stabilization protein  28.33 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.171886  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5841  PilT domain-containing protein  29.51 
 
 		 141 aa  42.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3455  PilT protein, N-terminal  31.97 
 
 		 144 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0985  PilT domain-containing protein  25.4 
 
 		 129 aa  42  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.483809  normal  0.193625 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3680  PilT protein domain protein  29.69 
 
 		 134 aa  42  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3942  PilT protein domain protein  23.7 
 
 		 152 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3269  PilT protein-like  28.8 
 
 		 133 aa  41.2  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159462  hitchhiker  0.00995267 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10638  hypothetical protein  22.77 
 
 		 135 aa  41.6  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000594146  normal  0.603416 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1045  virulence-associated protein, putative  27.34 
 
 		 134 aa  40.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.491192  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1138  PilT domain-containing protein  31.96 
 
 		 133 aa  40.8  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3939  PilT protein domain protein  26.56 
 
 		 133 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0894  PilT protein, N-terminal  27.34 
 
 		 134 aa  40.4  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.282292 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3027  PilT protein domain protein  30.65 
 
 		 140 aa  40.8  0.007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0189555 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0713  PilT domain-containing protein  29.27 
 
 		 141 aa  40.4  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000185206  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1461  PilT protein domain protein  29.69 
 
 		 134 aa  40  0.009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0728  PilT protein domain protein  32 
 
 		 132 aa  40.4  0.009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.741529  hitchhiker  0.0000801582 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1533  PilT protein domain protein  27.69 
 
 		 132 aa  40.4  0.009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0497484  hitchhiker  0.000597174 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0946  PilT domain-containing protein  25.4 
 
 		 135 aa  40  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000374994  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>