67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2505 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_2505  PilT protein-like  100 
 
 		 147 aa  305  1.0000000000000001e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00228638  normal  0.384652 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5182  PilT domain-containing protein  48.63 
 
 		 149 aa  154  3e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.27524  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3942  PilT protein domain protein  45.21 
 
 		 152 aa  144  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3991  PilT protein domain protein  43.15 
 
 		 152 aa  138  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.10183 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2936  PilT domain-containing protein  28.57 
 
 		 130 aa  64.3  0.0000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.203821 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1337  PilT protein domain protein  31.72 
 
 		 129 aa  63.5  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.1325  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1067  PilT protein domain protein  33.33 
 
 		 134 aa  62  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1433  NtrR protein  30.61 
 
 		 140 aa  61.2  0.000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0898  PilT protein domain protein  31.29 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.185586  normal  0.0272728 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0478  virulence-associated protein, putative  31.29 
 
 		 134 aa  60.1  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0638  PilT protein domain protein  31.29 
 
 		 136 aa  60.1  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2127  vapC protein, putative  29.05 
 
 		 133 aa  58.9  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2669  PilT protein-like  29.73 
 
 		 132 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0691561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1319  PilT protein domain protein  29.8 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0151  PilT protein domain protein  27.7 
 
 		 137 aa  58.2  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.85559  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1848  PilT protein domain protein  31.72 
 
 		 129 aa  57  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2366  PilT protein domain protein  27.78 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1904  PilT protein domain protein  31.34 
 
 		 129 aa  54.3  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.101114 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0688  PilT domain-containing protein  31.29 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.442109  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2777  PilT protein domain protein  29.25 
 
 		 134 aa  52.4  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1812  PilT domain-containing protein  28.03 
 
 		 132 aa  52  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.034692  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0657  PilT protein domain protein  28.68 
 
 		 129 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3269  PilT protein-like  28.67 
 
 		 133 aa  50.8  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159462  hitchhiker  0.00995267 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5055  PilT domain-containing protein  28.86 
 
 		 133 aa  50.8  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1325  nucleic acid binding protein  31.54 
 
 		 133 aa  49.7  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.000000000000354508  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4624  PilT domain-containing protein  26.53 
 
 		 136 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.723585  normal  0.112001 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1213  virulence associated protein C  27.66 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3729  PilT protein-like  29.53 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.294534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8106  PilT protein domain protein  27.89 
 
 		 138 aa  48.1  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3939  PilT protein domain protein  29.05 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2468  PilT protein domain protein  30.07 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0500169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1063  PilT protein domain protein  29.33 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.471234  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0156  PilT protein domain protein  28.19 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0286  PilT protein domain protein  28.77 
 
 		 135 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.024358  decreased coverage  0.0024847 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0602  PilT protein domain protein  26.53 
 
 		 135 aa  47.8  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.191075  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4147  PilT domain-containing protein  29.53 
 
 		 134 aa  47.4  0.00006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.448502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2552  PilT domain-containing protein  30.32 
 
 		 152 aa  47.4  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.748536  normal  0.0339823 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3988  PilT protein domain protein  28.95 
 
 		 133 aa  47.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0532731 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3905  PilT domain-containing protein  27.21 
 
 		 134 aa  47.4  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.646522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4819  PilT protein domain protein  29.91 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0442  nitrogen regulatory protein NtrR  27.7 
 
 		 134 aa  46.2  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.315733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2281  PilT protein domain protein  26.15 
 
 		 113 aa  45.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.913458  hitchhiker  0.0000308693 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2655  PIN domain protein  26.15 
 
 		 128 aa  45.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0483  PilT domain-containing protein  27.63 
 
 		 133 aa  45.8  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1509  PilT domain-containing protein  24.66 
 
 		 147 aa  45.1  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.203613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1769  hypothetical protein  24.31 
 
 		 131 aa  44.7  0.0004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4014  PilT protein domain protein  24.16 
 
 		 137 aa  44.7  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00102621  hitchhiker  0.000259631 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1045  virulence-associated protein, putative  24.49 
 
 		 134 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.491192  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0305  PilT protein domain protein  29.63 
 
 		 128 aa  44.3  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0032427  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2597  PilT protein-like protein  28 
 
 		 133 aa  44.7  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3968  PilT domain-containing protein  24.49 
 
 		 135 aa  44.3  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.10464  normal  0.34904 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2061  PilT protein-like  26.53 
 
 		 137 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.464796 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1623  virulence associated protein VagD, putative  27.7 
 
 		 134 aa  44.3  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3680  PilT protein domain protein  27.52 
 
 		 134 aa  43.9  0.0007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6178  PilT protein, N-terminal  26.03 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.382745  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0894  PilT protein, N-terminal  23.81 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.282292 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1868  PilT domain-containing protein  24.44 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000212984  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10607  hypothetical protein  27.03 
 
 		 130 aa  42.7  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.353151 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1461  PilT protein domain protein  30.2 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6878  PilT domain-containing protein  25.83 
 
 		 136 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.425666  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2472  virulence associated protein C  24.66 
 
 		 133 aa  41.6  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00148493  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6255  PilT domain-containing protein  24.83 
 
 		 135 aa  41.6  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0358672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0728  PilT protein domain protein  27.89 
 
 		 132 aa  41.6  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.741529  hitchhiker  0.0000801582 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1533  PilT protein domain protein  23.45 
 
 		 132 aa  41.6  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0497484  hitchhiker  0.000597174 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3267  plasmid maintenance protein  22.67 
 
 		 132 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3368  plasmid maintenance protein  22.67 
 
 		 133 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3461  PilT domain-containing protein  23.81 
 
 		 135 aa  40  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.999718 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>