117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1848 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1848  PilT protein domain protein  100 
 
 		 129 aa  261  3e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1337  PilT protein domain protein  55.81 
 
 		 129 aa  155  1e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.1325  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1904  PilT protein domain protein  57.14 
 
 		 129 aa  147  4e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.101114 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2936  PilT domain-containing protein  42.86 
 
 		 130 aa  94  6e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.203821 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0305  PilT protein domain protein  42.06 
 
 		 128 aa  93.2  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0032427  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1812  PilT domain-containing protein  35.77 
 
 		 132 aa  84.3  5e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.034692  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1840  PilT domain-containing protein  34.96 
 
 		 135 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0657  PilT protein domain protein  34.68 
 
 		 129 aa  82.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3968  PilT domain-containing protein  39.53 
 
 		 135 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.10464  normal  0.34904 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0688  PilT domain-containing protein  38.76 
 
 		 132 aa  80.1  0.00000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.442109  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0898  PilT protein domain protein  36.43 
 
 		 131 aa  77.8  0.00000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.185586  normal  0.0272728 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1067  PilT protein domain protein  38.28 
 
 		 134 aa  77.8  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3461  PilT domain-containing protein  38.76 
 
 		 135 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.999718 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1138  PilT domain-containing protein  38.76 
 
 		 133 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6178  PilT protein, N-terminal  37.98 
 
 		 133 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.382745  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4187  DNA replication protein-like protein  38.76 
 
 		 135 aa  72.8  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.49294 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2951  PilT domain-containing protein  35.66 
 
 		 136 aa  73.2  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1533  PilT protein domain protein  32.56 
 
 		 132 aa  71.2  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0497484  hitchhiker  0.000597174 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4076  plamid maintenance protein  38.76 
 
 		 135 aa  70.5  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0286  PilT protein domain protein  34.62 
 
 		 135 aa  70.5  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.024358  decreased coverage  0.0024847 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8106  PilT protein domain protein  34.96 
 
 		 138 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3939  PilT protein domain protein  35.09 
 
 		 133 aa  68.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2669  PilT protein-like  33.59 
 
 		 132 aa  68.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0691561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5055  PilT domain-containing protein  35.66 
 
 		 133 aa  67.4  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1045  virulence-associated protein, putative  34.11 
 
 		 134 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.491192  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2777  PilT protein domain protein  34.11 
 
 		 134 aa  65.9  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0638  PilT protein domain protein  33.83 
 
 		 136 aa  65.5  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3988  PilT protein domain protein  33.33 
 
 		 133 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0532731 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0478  virulence-associated protein, putative  33.85 
 
 		 134 aa  65.1  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0152  PilT protein domain protein  34.85 
 
 		 134 aa  65.1  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3905  PilT domain-containing protein  35.38 
 
 		 134 aa  64.7  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.646522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5182  PilT domain-containing protein  35.17 
 
 		 149 aa  64.3  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.27524  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0894  PilT protein, N-terminal  33.33 
 
 		 134 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.282292 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1213  virulence associated protein C  36.43 
 
 		 138 aa  63.5  0.0000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2127  vapC protein, putative  29.46 
 
 		 133 aa  63.2  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3680  PilT protein domain protein  34.11 
 
 		 134 aa  62.8  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1325  nucleic acid binding protein  33.58 
 
 		 133 aa  62.8  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.000000000000354508  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1868  PilT domain-containing protein  32.31 
 
 		 133 aa  62.4  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000212984  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2472  virulence associated protein C  33.08 
 
 		 133 aa  62  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00148493  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1771  hypothetical protein  31.78 
 
 		 133 aa  60.8  0.000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4600  putative nitrogen regulatory protein (NtrR-like), putative virulence associated protein (vap)  39.23 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.660475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1063  PilT protein domain protein  32.82 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.471234  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4624  PilT domain-containing protein  31.78 
 
 		 136 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.723585  normal  0.112001 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4437  PilT protein-like  36.43 
 
 		 134 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0442  nitrogen regulatory protein NtrR  34.59 
 
 		 134 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.315733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1788  PilT protein domain protein  31.78 
 
 		 136 aa  58.2  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.813085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3942  PilT protein domain protein  31.72 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2129  virulence-associated protein, putative  31.78 
 
 		 136 aa  58.2  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0156283  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1461  PilT protein domain protein  34.11 
 
 		 134 aa  58.5  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0701  PilT protein domain protein  32.56 
 
 		 136 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.528227 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0156  PilT protein domain protein  35.34 
 
 		 134 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0440  PilT protein-like  34.11 
 
 		 134 aa  57.4  0.00000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000179252  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2505  PilT protein-like  31.72 
 
 		 147 aa  57  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00228638  normal  0.384652 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3269  PilT protein-like  32.56 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159462  hitchhiker  0.00995267 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0602  PilT protein domain protein  33.08 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.191075  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3729  PilT protein-like  33.08 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.294534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2826  PilT protein-like  32.58 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.640016  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4829  PilT protein domain protein  33.61 
 
 		 130 aa  54.7  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4147  PilT domain-containing protein  32.33 
 
 		 134 aa  54.7  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.448502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3991  PilT protein domain protein  30.34 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.10183 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3267  plasmid maintenance protein  28.68 
 
 		 132 aa  54.7  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2597  PilT protein-like protein  35.38 
 
 		 133 aa  53.5  0.0000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0505  PilT protein domain protein  25.4 
 
 		 131 aa  53.9  0.0000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1484  hypothetical protein  31.88 
 
 		 141 aa  53.5  0.0000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.174904  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2719  PilT protein-like  29.93 
 
 		 151 aa  52  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.116591 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0713  PilT domain-containing protein  34.43 
 
 		 141 aa  52.4  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000185206  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1627  PilT protein domain protein  31.78 
 
 		 136 aa  52.4  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.733144  normal  0.420461 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2468  PilT protein domain protein  34.75 
 
 		 135 aa  52.4  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0500169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0397  PilT protein-like  26.6 
 
 		 123 aa  51.2  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3368  plasmid maintenance protein  27.91 
 
 		 133 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6255  PilT domain-containing protein  32.31 
 
 		 135 aa  50.8  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0358672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0091  PilT protein-like  30 
 
 		 144 aa  49.7  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0017  PilT domain-containing protein  32.35 
 
 		 138 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.461831  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0141  plasmid maintenance protein VagD  31.62 
 
 		 138 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1340  PilT protein domain protein  28 
 
 		 129 aa  50.1  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.382871  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6878  PilT domain-containing protein  31.54 
 
 		 136 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.425666  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1319  PilT protein domain protein  31.3 
 
 		 140 aa  48.9  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0985  PilT domain-containing protein  29.59 
 
 		 129 aa  48.5  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.483809  normal  0.193625 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1433  NtrR protein  27.48 
 
 		 140 aa  48.1  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4014  PilT protein domain protein  32.35 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00102621  hitchhiker  0.000259631 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03915  predicted nucleic acid-binding protein,contains PIN domain  28.87 
 
 		 101 aa  47.8  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.968864  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2552  PilT domain-containing protein  31.39 
 
 		 152 aa  47.4  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.748536  normal  0.0339823 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0267  PilT protein domain protein  32.67 
 
 		 127 aa  47  0.00009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0148282 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3757  PilT domain-containing protein  29.46 
 
 		 135 aa  46.2  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00272094  normal  0.0228653 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0728  PilT protein domain protein  33.83 
 
 		 132 aa  46.2  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.741529  hitchhiker  0.0000801582 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3732  nucleic acid-binding protein  28.57 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1183  PilT protein domain protein  26.89 
 
 		 119 aa  45.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0414  PilT protein domain protein  26.15 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3585  PilT protein domain protein  27.18 
 
 		 129 aa  46.2  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0058  PilT protein domain protein  32.35 
 
 		 118 aa  44.3  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0223117  normal  0.362621 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0483  PilT domain-containing protein  33.33 
 
 		 133 aa  43.9  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0058  PilT protein domain protein  25.41 
 
 		 148 aa  43.9  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3079  PilT protein-like  31.01 
 
 		 146 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.046913  normal  0.55485 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0795  PilT protein-like protein  33.33 
 
 		 95 aa  43.9  0.0008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3346  PilT protein-like  29.46 
 
 		 146 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.732175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3304  PilT protein domain protein  31.75 
 
 		 126 aa  43.5  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1526  PilT protein domain protein  31.82 
 
 		 138 aa  43.1  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0155  PilT protein domain protein  28.99 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.538447 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4425  PilT domain-containing protein  25.69 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00042868 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5884  PilT domain-containing protein  30.23 
 
 		 148 aa  42.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.669409 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>