22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0267 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0267  PilT protein domain protein  100 
 
 		 127 aa  253  5e-67  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0148282 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3304  PilT protein domain protein  48.03 
 
 		 126 aa  115  3e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4829  PilT protein domain protein  40 
 
 		 130 aa  83.2  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0985  PilT domain-containing protein  31.2 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.483809  normal  0.193625 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4050  PilT protein domain protein  29.06 
 
 		 131 aa  54.7  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1702  PilT domain-containing protein  30.77 
 
 		 130 aa  52  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0160  PilT protein domain protein  35.4 
 
 		 131 aa  51.2  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.221869  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2557  PilT protein domain protein  30.6 
 
 		 135 aa  51.2  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.308124  normal  0.19537 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1337  PilT protein domain protein  31.31 
 
 		 129 aa  50.4  0.000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.1325  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1110  PilT protein domain protein  32.58 
 
 		 138 aa  50.4  0.000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.871777  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3585  PilT protein domain protein  28.91 
 
 		 129 aa  48.9  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1433  PilT protein domain protein  30.23 
 
 		 130 aa  49.3  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.697875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1340  PilT protein domain protein  33.85 
 
 		 129 aa  47.8  0.00006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.382871  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1848  PilT protein domain protein  32.67 
 
 		 129 aa  47  0.00009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1904  PilT protein domain protein  29.03 
 
 		 129 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.101114 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1533  PilT protein domain protein  30.33 
 
 		 132 aa  46.2  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0497484  hitchhiker  0.000597174 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0397  PilT protein-like  25.74 
 
 		 123 aa  45.4  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3968  PilT domain-containing protein  32.06 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.10464  normal  0.34904 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4147  PilT domain-containing protein  28.57 
 
 		 134 aa  42  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.448502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4437  PilT protein-like  31.34 
 
 		 134 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2127  vapC protein, putative  28.12 
 
 		 133 aa  40.8  0.006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0420  PilT protein domain protein  40.98 
 
 		 137 aa  40.4  0.009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>