50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1702 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1702  PilT domain-containing protein  100 
 
 		 130 aa  257  3e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0985  PilT domain-containing protein  46.92 
 
 		 129 aa  119  9.999999999999999e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.483809  normal  0.193625 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0397  PilT protein-like  43.09 
 
 		 123 aa  110  7.000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1433  PilT protein domain protein  29.92 
 
 		 130 aa  63.2  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.697875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2557  PilT protein domain protein  33.33 
 
 		 135 aa  62  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.308124  normal  0.19537 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1337  PilT protein domain protein  32.28 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.1325  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1904  PilT protein domain protein  31.2 
 
 		 129 aa  57.8  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.101114 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4624  PilT domain-containing protein  32.81 
 
 		 136 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.723585  normal  0.112001 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0286  PilT protein domain protein  30.23 
 
 		 135 aa  53.9  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.024358  decreased coverage  0.0024847 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1769  hypothetical protein  29.01 
 
 		 131 aa  52.8  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6878  PilT domain-containing protein  35.16 
 
 		 136 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.425666  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0267  PilT protein domain protein  30.77 
 
 		 127 aa  52  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0148282 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3680  PilT protein domain protein  29.69 
 
 		 134 aa  51.6  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1340  PilT protein domain protein  28.91 
 
 		 129 aa  51.2  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.382871  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2951  PilT domain-containing protein  32.81 
 
 		 136 aa  50.8  0.000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3732  nucleic acid-binding protein  34.11 
 
 		 132 aa  50.1  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1319  PilT protein domain protein  33.08 
 
 		 140 aa  49.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1461  PilT protein domain protein  29.69 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2552  PilT domain-containing protein  30.6 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.748536  normal  0.0339823 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1213  virulence associated protein C  32.06 
 
 		 138 aa  48.9  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3757  PilT domain-containing protein  32.81 
 
 		 135 aa  48.9  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00272094  normal  0.0228653 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1045  virulence-associated protein, putative  30.47 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.491192  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1325  nucleic acid binding protein  30.47 
 
 		 133 aa  48.1  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.000000000000354508  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0898  PilT protein domain protein  34.38 
 
 		 131 aa  47.8  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.185586  normal  0.0272728 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2127  vapC protein, putative  25.76 
 
 		 133 aa  47.4  0.00006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0894  PilT protein, N-terminal  29.69 
 
 		 134 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.282292 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2936  PilT domain-containing protein  29.77 
 
 		 130 aa  47.4  0.00007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.203821 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5055  PilT domain-containing protein  30.89 
 
 		 133 aa  47  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1788  PilT protein domain protein  29.69 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.813085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2129  virulence-associated protein, putative  29.69 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0156283  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1138  PilT domain-containing protein  33.33 
 
 		 133 aa  46.2  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0440  PilT protein-like  28.12 
 
 		 134 aa  44.7  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000179252  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1183  PilT protein domain protein  29.17 
 
 		 119 aa  44.3  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3267  plasmid maintenance protein  27.48 
 
 		 132 aa  44.3  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1609  PilT domain-containing protein  29.85 
 
 		 131 aa  44.3  0.0006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00219801  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2719  PilT protein-like  30.53 
 
 		 151 aa  44.3  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.116591 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1823  PilT domain-containing protein  30.71 
 
 		 142 aa  44.3  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.402154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3368  plasmid maintenance protein  28.03 
 
 		 133 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2669  PilT protein-like  27.69 
 
 		 132 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0691561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0420  PilT protein domain protein  31.4 
 
 		 137 aa  43.5  0.0009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3558  PilT domain-containing protein  29.1 
 
 		 128 aa  43.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3461  PilT domain-containing protein  29.92 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.999718 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0478  virulence-associated protein, putative  28.12 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3939  PilT protein domain protein  27.66 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0638  PilT protein domain protein  28.12 
 
 		 136 aa  42.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1848  PilT protein domain protein  25.2 
 
 		 129 aa  42.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0505  PilT protein domain protein  24 
 
 		 131 aa  42  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0152  PilT protein domain protein  26.36 
 
 		 134 aa  41.2  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4600  putative nitrogen regulatory protein (NtrR-like), putative virulence associated protein (vap)  30.77 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.660475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0058  PilT protein domain protein  31.34 
 
 		 148 aa  40.8  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>