18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2557 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2557  PilT protein domain protein  100 
 
 		 135 aa  268  2e-71  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.308124  normal  0.19537 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1340  PilT protein domain protein  41.48 
 
 		 129 aa  97.8  4e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.382871  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3585  PilT protein domain protein  39.26 
 
 		 129 aa  89.4  1e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1433  PilT protein domain protein  37.78 
 
 		 130 aa  81.6  0.000000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.697875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0114  hypothetical protein  73.17 
 
 		 55 aa  66.6  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.983042  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0985  PilT domain-containing protein  33.08 
 
 		 129 aa  65.9  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.483809  normal  0.193625 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0058  PilT protein domain protein  35.83 
 
 		 118 aa  65.5  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0223117  normal  0.362621 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1702  PilT domain-containing protein  33.33 
 
 		 130 aa  62  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0012  PilT protein domain-containing protein  30.43 
 
 		 133 aa  51.6  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.948131 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0267  PilT protein domain protein  30.6 
 
 		 127 aa  51.2  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0148282 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0397  PilT protein-like  27.97 
 
 		 123 aa  50.8  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0505  PilT protein domain protein  27.48 
 
 		 131 aa  47.8  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1769  hypothetical protein  24.63 
 
 		 131 aa  44.7  0.0005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4829  PilT protein domain protein  26.92 
 
 		 130 aa  43.9  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1904  PilT protein domain protein  22.22 
 
 		 129 aa  42  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.101114 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3558  PilT domain-containing protein  33.63 
 
 		 128 aa  41.6  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4187  DNA replication protein-like protein  25.37 
 
 		 135 aa  40.8  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.49294 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1183  PilT protein domain protein  31.37 
 
 		 119 aa  40.4  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>