76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_3585 on replicon NC_012030
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012030  Hlac_3585  PilT protein domain protein  100 
 
 		 129 aa  260  4e-69  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1340  PilT protein domain protein  74.42 
 
 		 129 aa  199  9.999999999999999e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.382871  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0058  PilT protein domain protein  77.12 
 
 		 118 aa  191  3e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0223117  normal  0.362621 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2557  PilT protein domain protein  39.26 
 
 		 135 aa  89.4  1e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.308124  normal  0.19537 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1433  PilT protein domain protein  39.23 
 
 		 130 aa  89  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.697875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0985  PilT domain-containing protein  37.82 
 
 		 129 aa  74.3  0.0000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.483809  normal  0.193625 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1183  PilT protein domain protein  35.65 
 
 		 119 aa  63.9  0.0000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0602  PilT protein domain protein  34.43 
 
 		 135 aa  63.5  0.0000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.191075  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2987  PilT protein domain protein  30.23 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2936  PilT domain-containing protein  28.1 
 
 		 130 aa  52.8  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.203821 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0152  PilT protein domain protein  29.75 
 
 		 134 aa  53.5  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0091  PilT domain-containing protein  29.75 
 
 		 132 aa  52.8  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0728  PilT protein domain protein  29.27 
 
 		 132 aa  52  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.741529  hitchhiker  0.0000801582 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3757  PilT domain-containing protein  33.7 
 
 		 135 aa  51.6  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00272094  normal  0.0228653 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0397  PilT protein-like  32.43 
 
 		 123 aa  50.8  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6255  PilT domain-containing protein  31.97 
 
 		 135 aa  50.4  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0358672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3346  PilT protein-like  33.58 
 
 		 146 aa  50.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.732175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4187  DNA replication protein-like protein  27.87 
 
 		 135 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.49294 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1138  PilT domain-containing protein  26.83 
 
 		 133 aa  50.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0894  PilT protein, N-terminal  27.05 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.282292 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1063  PilT protein domain protein  27.87 
 
 		 139 aa  48.9  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.471234  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4076  plamid maintenance protein  27.87 
 
 		 135 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0505  PilT protein domain protein  26.45 
 
 		 131 aa  49.3  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5884  PilT domain-containing protein  31.85 
 
 		 148 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.669409 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0267  PilT protein domain protein  28.91 
 
 		 127 aa  48.9  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0148282 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0688  PilT domain-containing protein  27.27 
 
 		 132 aa  48.1  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.442109  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6878  PilT domain-containing protein  31.15 
 
 		 136 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.425666  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0091  PilT protein-like  34.34 
 
 		 144 aa  47.8  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4147  PilT domain-containing protein  29.51 
 
 		 134 aa  47.8  0.00006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.448502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1533  PilT protein domain protein  27.2 
 
 		 132 aa  47.4  0.00006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0497484  hitchhiker  0.000597174 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3079  PilT protein-like  31.58 
 
 		 146 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.046913  normal  0.55485 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1876  PilT protein domain protein  31.71 
 
 		 129 aa  47  0.00008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1213  virulence associated protein C  27.56 
 
 		 138 aa  47  0.00008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2084  PilT protein-like protein  36.36 
 
 		 135 aa  47  0.00008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.236876  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1681  PilT protein-like  32 
 
 		 136 aa  47  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.116331  normal  0.664267 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1337  PilT protein domain protein  25.58 
 
 		 129 aa  45.4  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.1325  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1848  PilT protein domain protein  27.18 
 
 		 129 aa  46.2  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3368  plasmid maintenance protein  33.71 
 
 		 133 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.911  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1045  virulence-associated protein, putative  25.41 
 
 		 134 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.491192  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3267  plasmid maintenance protein  30.33 
 
 		 132 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12568  hypothetical protein  30.51 
 
 		 125 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.724019  normal  0.141761 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2472  virulence associated protein C  27.05 
 
 		 133 aa  45.1  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00148493  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1788  PilT protein domain protein  27.27 
 
 		 136 aa  45.1  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.813085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4014  PilT protein domain protein  31.15 
 
 		 137 aa  45.1  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00102621  hitchhiker  0.000259631 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2129  virulence-associated protein, putative  27.27 
 
 		 136 aa  45.1  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0156283  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11426  hypothetical protein  39.39 
 
 		 133 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.3127099999999998e-21  normal  0.106237 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36180  PilT domain-containing protein  28.33 
 
 		 136 aa  44.3  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5055  PilT domain-containing protein  28.93 
 
 		 133 aa  43.9  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1904  PilT protein domain protein  27.18 
 
 		 129 aa  43.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.101114 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1461  PilT protein domain protein  23.97 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0442  nitrogen regulatory protein NtrR  26.23 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.315733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1627  PilT protein domain protein  28.46 
 
 		 136 aa  43.5  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.733144  normal  0.420461 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3680  PilT protein domain protein  23.14 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4420  PilT protein domain protein  26.02 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1675  PilT domain-containing protein  26.23 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000215959 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1067  PilT protein domain protein  28.46 
 
 		 134 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1325  nucleic acid binding protein  27.27 
 
 		 133 aa  42  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.000000000000354508  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10638  hypothetical protein  31.75 
 
 		 135 aa  41.6  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000594146  normal  0.603416 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1127  PilT domain-containing protein  27.97 
 
 		 133 aa  41.6  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.539233 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3461  PilT domain-containing protein  24.59 
 
 		 135 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.999718 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6178  PilT protein, N-terminal  28.09 
 
 		 133 aa  40.8  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.382745  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1823  PilT domain-containing protein  31.34 
 
 		 142 aa  40.8  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.402154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2669  PilT protein-like  26.92 
 
 		 132 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0691561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3968  PilT domain-containing protein  24.59 
 
 		 135 aa  40.8  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.10464  normal  0.34904 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0156  PilT protein domain protein  27.87 
 
 		 134 aa  40.8  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0983  PilT domain-containing protein  29.27 
 
 		 133 aa  40.4  0.008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1771  hypothetical protein  24.24 
 
 		 133 aa  40.4  0.008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2617  nucleic acid binding protein  28.95 
 
 		 134 aa  40.4  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.243477 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1868  PilT domain-containing protein  25.41 
 
 		 133 aa  40.4  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000212984  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0478  virulence-associated protein, putative  25.41 
 
 		 134 aa  40.4  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0638  PilT protein domain protein  25.41 
 
 		 136 aa  40.4  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4543  PilT protein domain protein  36.17 
 
 		 136 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5766  PilT protein domain protein  29.51 
 
 		 126 aa  40  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.300152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2468  PilT protein domain protein  29.01 
 
 		 135 aa  40  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0500169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4062  PilT protein domain protein  32.59 
 
 		 155 aa  40  0.01  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3732  nucleic acid-binding protein  30.33 
 
 		 132 aa  40  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>