29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1433 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1433  PilT protein domain protein  100 
 
 		 130 aa  260  4e-69  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.697875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1340  PilT protein domain protein  38.46 
 
 		 129 aa  90.1  1e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.382871  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3585  PilT protein domain protein  39.23 
 
 		 129 aa  89  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2557  PilT protein domain protein  37.78 
 
 		 135 aa  81.6  0.000000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.308124  normal  0.19537 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0058  PilT protein domain protein  36.13 
 
 		 118 aa  73.2  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0223117  normal  0.362621 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1183  PilT protein domain protein  40.21 
 
 		 119 aa  69.3  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0985  PilT domain-containing protein  32.56 
 
 		 129 aa  63.9  0.0000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.483809  normal  0.193625 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1702  PilT domain-containing protein  29.92 
 
 		 130 aa  63.2  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0505  PilT protein domain protein  32.98 
 
 		 131 aa  60.1  0.000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2498  PilT protein domain protein  32.8 
 
 		 136 aa  58.5  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0159803 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4829  PilT protein domain protein  29.84 
 
 		 130 aa  55.1  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4420  PilT protein domain protein  34.04 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0602  PilT protein domain protein  36.08 
 
 		 135 aa  52.4  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.191075  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1533  PilT protein domain protein  28.57 
 
 		 132 aa  50.8  0.000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0497484  hitchhiker  0.000597174 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4042  PilT protein domain protein  34.97 
 
 		 184 aa  50.4  0.000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.72027 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0267  PilT protein domain protein  30.23 
 
 		 127 aa  49.3  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0148282 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4062  PilT protein domain protein  35.77 
 
 		 155 aa  48.9  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0152  PilT protein domain protein  29.92 
 
 		 134 aa  47  0.00008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0728  PilT protein domain protein  31.9 
 
 		 132 aa  47  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.741529  hitchhiker  0.0000801582 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3714  PilT protein domain protein  43.1 
 
 		 139 aa  45.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.440396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1904  PilT protein domain protein  26.19 
 
 		 129 aa  45.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.101114 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1138  PilT domain-containing protein  26.53 
 
 		 133 aa  44.7  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5766  PilT protein domain protein  28.91 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.300152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0420  PilT protein domain protein  31.93 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2155  hypothetical protein  34.02 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0983  PilT domain-containing protein  41.18 
 
 		 133 aa  42  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3757  PilT domain-containing protein  34.34 
 
 		 135 aa  42  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00272094  normal  0.0228653 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0286  PilT protein domain protein  28.87 
 
 		 135 aa  40.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.024358  decreased coverage  0.0024847 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0414  PilT protein domain protein  36.54 
 
 		 135 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>