21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_4042 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_4042  PilT protein domain protein  100 
 
 		 184 aa  381  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.72027 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4062  PilT protein domain protein  97.33 
 
 		 155 aa  299  2e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3688  PilT protein domain protein  59.46 
 
 		 156 aa  195  3e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5262  PilT protein domain protein  32.9 
 
 		 142 aa  50.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0679342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2498  PilT protein domain protein  31.76 
 
 		 136 aa  50.1  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0159803 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1433  PilT protein domain protein  34.97 
 
 		 130 aa  50.4  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.697875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4538  PilT protein domain protein  27.74 
 
 		 140 aa  48.9  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.104439 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1183  PilT protein domain protein  33 
 
 		 119 aa  47.8  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0679  PilT protein-like  26.11 
 
 		 158 aa  46.6  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000163156  unclonable  0.00000001 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0505  putative plasmid stability protein  30.14 
 
 		 145 aa  44.7  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.294814 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3431  PilT domain-containing protein  28.86 
 
 		 121 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2339  PilT protein domain protein  37.14 
 
 		 141 aa  42  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4014  PilT protein domain protein  30.26 
 
 		 137 aa  42  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00102621  hitchhiker  0.000259631 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4092  PilT domain-containing protein  28.86 
 
 		 121 aa  42  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4274  PilT protein-like  28.86 
 
 		 121 aa  42  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3902  PilT domain-containing protein  26.43 
 
 		 136 aa  41.2  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4581  PilT protein-like  31.69 
 
 		 140 aa  41.2  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.766949  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2534  PilT protein, N-terminal  35.14 
 
 		 137 aa  41.2  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.641844  normal  0.62652 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1443  PilT domain-containing protein  26.32 
 
 		 125 aa  41.2  0.009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0125509  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2343  PilT domain-containing protein  24.6 
 
 		 133 aa  41.2  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.487913  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1382  hypothetical protein  26.32 
 
 		 125 aa  41.2  0.009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000499389  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>