38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_3431 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_3431  PilT domain-containing protein  100 
 
 		 121 aa  242  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4092  PilT domain-containing protein  99.17 
 
 		 121 aa  240  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4274  PilT protein-like  99.17 
 
 		 121 aa  240  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1142  nucleic acid-binding protein  58.68 
 
 		 121 aa  153  7e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1062  PilT protein-like  57.02 
 
 		 121 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2082  PilT protein domain protein  50.41 
 
 		 121 aa  134  3.0000000000000003e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.951724  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0051  PilT domain-containing protein  51.24 
 
 		 126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.330837 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1201  PilT protein-like  45.45 
 
 		 121 aa  110  5e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0955216  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1367  PilT protein-like protein  41.32 
 
 		 126 aa  92.8  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.381279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2659  nucleic acid binding protein  40.52 
 
 		 127 aa  72  0.000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.234415  normal  0.629356 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0681  hypothetical protein  36.29 
 
 		 127 aa  67.4  0.00000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000394475  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0656  nucleic acid binding protein  37.29 
 
 		 126 aa  63.9  0.0000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.388004  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0599  PilT domain-containing protein  33.33 
 
 		 128 aa  56.2  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6219  PilT protein domain protein  31.82 
 
 		 129 aa  53.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.314877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1389  nucleic acid binding protein  29.73 
 
 		 125 aa  50.8  0.000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0940077  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1554  PilT protein domain protein  34.02 
 
 		 125 aa  49.3  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.19075  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3131  PilT protein domain protein  35.56 
 
 		 124 aa  48.9  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0679  PilT protein-like  30.89 
 
 		 158 aa  48.1  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000163156  unclonable  0.00000001 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1380  PilT domain-containing protein  30.89 
 
 		 128 aa  48.5  0.00003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.978498  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1321  PIN domain protein  30.89 
 
 		 130 aa  48.5  0.00003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.282385  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5766  PilT protein domain protein  31.67 
 
 		 126 aa  46.2  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.300152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2343  PilT domain-containing protein  27.93 
 
 		 133 aa  44.3  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.487913  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4187  DNA replication protein-like protein  30.58 
 
 		 135 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.49294 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11426  hypothetical protein  33.62 
 
 		 133 aa  43.5  0.0009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.3127099999999998e-21  normal  0.106237 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4042  PilT protein domain protein  28.86 
 
 		 184 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.72027 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4062  PilT protein domain protein  27.03 
 
 		 155 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2620  PilT protein domain protein  30.08 
 
 		 134 aa  43.5  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1114  nucleic acid binding protein  34.62 
 
 		 100 aa  42.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3765  PilT protein domain protein  28.1 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3572  PilT protein domain protein  30.36 
 
 		 125 aa  42  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1663  PilT protein-like  26.85 
 
 		 120 aa  41.6  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0881523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1382  hypothetical protein  30.09 
 
 		 125 aa  41.6  0.004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000499389  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1443  PilT domain-containing protein  30.09 
 
 		 125 aa  41.6  0.004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0125509  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0252  PilT protein-like  29.09 
 
 		 155 aa  41.6  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4014  PilT protein domain protein  30.16 
 
 		 137 aa  41.2  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00102621  hitchhiker  0.000259631 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3865  PilT domain-containing protein  26.79 
 
 		 126 aa  40.8  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.870941  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4076  plamid maintenance protein  29.75 
 
 		 135 aa  40.8  0.007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1461  PilT protein domain protein  33.33 
 
 		 134 aa  40  0.01  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>