74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2620 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_2620  PilT protein domain protein  100 
 
 		 134 aa  270  3e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0552  PilT domain-containing protein  37.88 
 
 		 127 aa  72.4  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4109  PilT protein-like  38.17 
 
 		 127 aa  70.1  0.000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0141  PilT protein-like  39.01 
 
 		 157 aa  66.2  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3326  PilT domain-containing protein  38.97 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3714  PilT protein domain protein  37.31 
 
 		 139 aa  65.1  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.440396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5572  PilT domain-containing protein  37.12 
 
 		 126 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0396621  normal  0.199506 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4396  PilT protein domain protein  35.94 
 
 		 125 aa  58.2  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1623  virulence associated protein VagD, putative  35.66 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2468  PilT protein domain protein  32.81 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0500169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1540  PilT protein domain protein  33.08 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4014  PilT protein domain protein  33.33 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00102621  hitchhiker  0.000259631 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0286  PilT protein domain protein  30.71 
 
 		 135 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.024358  decreased coverage  0.0024847 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2733  PilT protein-like  35.88 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.489446  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1765  PilT protein domain protein  39.26 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0806025  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3939  PilT protein domain protein  33.82 
 
 		 133 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1362  plasmid stability protein, putative  32.12 
 
 		 142 aa  50.4  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00298137  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3106  PilT domain-containing protein  34.88 
 
 		 127 aa  50.4  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.194845  normal  0.285105 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2498  PilT protein domain protein  27.27 
 
 		 136 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0159803 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0091  PilT domain-containing protein  33.58 
 
 		 132 aa  49.7  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3269  PilT protein-like  32.59 
 
 		 133 aa  48.9  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159462  hitchhiker  0.00995267 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1823  PilT domain-containing protein  33.59 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.402154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4019  PilT protein-like  31.65 
 
 		 144 aa  48.1  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.506281 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1183  PilT protein domain protein  34.21 
 
 		 119 aa  47.4  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4124  PilT domain-containing protein  35.66 
 
 		 128 aa  47.4  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.113441  normal  0.460306 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3767  PilT domain-containing protein  29.46 
 
 		 140 aa  47.4  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.546918  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0440  PilT protein-like  30.37 
 
 		 134 aa  47.4  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000179252  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1430  hypothetical protein  43.33 
 
 		 117 aa  47.4  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.87225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5181  PilT domain-containing protein  30.16 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0728  PilT protein domain protein  30.83 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.741529  hitchhiker  0.0000801582 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2505  PilT protein domain protein  32.61 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5837  PilT domain-containing protein  30.3 
 
 		 136 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.380144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1777  PilT domain-containing protein  30.6 
 
 		 143 aa  46.2  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.406004  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3903  PilT protein-like  30.3 
 
 		 136 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4465  PilT domain-containing protein  30.3 
 
 		 136 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2661  PilT domain-containing protein  30.65 
 
 		 124 aa  45.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3902  PilT domain-containing protein  30.3 
 
 		 136 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4538  PilT protein domain protein  32.58 
 
 		 140 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.104439 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3988  PilT protein domain protein  31.11 
 
 		 133 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0532731 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4364  PilT domain-containing protein  28.79 
 
 		 136 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2987  PilT protein domain protein  33.09 
 
 		 137 aa  44.3  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4819  PilT protein domain protein  35.43 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4028  PilT protein domain protein  30.37 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0898  PilT protein domain protein  30.53 
 
 		 131 aa  43.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.185586  normal  0.0272728 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0656  nucleic acid binding protein  26.77 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.388004  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3431  PilT domain-containing protein  30.08 
 
 		 121 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0469  PilT domain-containing protein  31.25 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1127  PilT domain-containing protein  28.79 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.539233 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1533  PilT protein domain protein  40.68 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0497484  hitchhiker  0.000597174 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3575  PilT protein domain protein  32.28 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00704853  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1067  PilT protein domain protein  31.06 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1063  PilT protein domain protein  30.88 
 
 		 139 aa  42  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.471234  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0154  PilT domain-containing protein  30.71 
 
 		 133 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0013  PilT protein-like  31.01 
 
 		 140 aa  42  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3905  PilT domain-containing protein  29.32 
 
 		 134 aa  41.6  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.646522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1142  nucleic acid-binding protein  28.57 
 
 		 121 aa  41.6  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4092  PilT domain-containing protein  29.27 
 
 		 121 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0602  PilT protein domain protein  31.16 
 
 		 135 aa  41.6  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.191075  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4274  PilT protein-like  29.27 
 
 		 121 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1045  PilT domain-containing protein  31.82 
 
 		 139 aa  41.2  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0543043  normal  0.324928 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3320  PilT protein-like  30.47 
 
 		 133 aa  41.2  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4589  PilT protein domain protein  29.46 
 
 		 139 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000022459  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36180  PilT domain-containing protein  30.16 
 
 		 136 aa  41.2  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0155  PilT protein domain protein  31.11 
 
 		 139 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.538447 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1048  PilT protein domain protein  40.68 
 
 		 109 aa  41.2  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.71366  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3474  PilT domain-containing protein  29.69 
 
 		 141 aa  40.8  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26779 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0138  PilT domain-containing protein  27.48 
 
 		 133 aa  40.8  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0701  PilT protein domain protein  27.86 
 
 		 136 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.528227 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0983  PilT domain-containing protein  28.03 
 
 		 133 aa  40.8  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3889  PilT domain-containing protein  35.16 
 
 		 142 aa  40.4  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2777  PilT protein domain protein  28.89 
 
 		 134 aa  40.4  0.009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1904  PilT protein domain protein  32.79 
 
 		 129 aa  40.4  0.009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.101114 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0505  putative plasmid stability protein  34.09 
 
 		 145 aa  40  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.294814 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3962  PilT domain-containing protein  32.82 
 
 		 137 aa  40  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1997 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>