59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3106 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3106  PilT domain-containing protein  100 
 
 		 127 aa  244  2e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.194845  normal  0.285105 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4109  PilT protein-like  78.74 
 
 		 127 aa  204  5e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0552  PilT domain-containing protein  80.31 
 
 		 127 aa  204  5e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5572  PilT domain-containing protein  66.39 
 
 		 126 aa  139  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0396621  normal  0.199506 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4396  PilT protein domain protein  45.16 
 
 		 125 aa  92  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0141  PilT protein-like  43.07 
 
 		 157 aa  91.7  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3714  PilT protein domain protein  41.73 
 
 		 139 aa  82.8  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.440396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3326  PilT domain-containing protein  42.54 
 
 		 143 aa  80.5  0.000000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1765  PilT protein domain protein  41.86 
 
 		 142 aa  80.5  0.000000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0806025  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10638  hypothetical protein  45.08 
 
 		 135 aa  77.4  0.00000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000594146  normal  0.603416 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3212  PilT protein domain protein  42.62 
 
 		 128 aa  73.6  0.0000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0181493  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1540  PilT protein domain protein  44.8 
 
 		 137 aa  72.4  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0038  PilT domain-containing protein  37.4 
 
 		 146 aa  70.1  0.000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10607  hypothetical protein  37.69 
 
 		 130 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.353151 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2620  PilT protein domain protein  34.88 
 
 		 134 aa  63.2  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2016  hypothetical protein  42.31 
 
 		 112 aa  62.8  0.000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4470  ABC transporter related  70.21 
 
 		 183 aa  62  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4819  PilT protein domain protein  37.21 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10678  hypothetical protein  39.22 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2150  PilT protein-like  35.64 
 
 		 133 aa  53.5  0.0000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4538  PilT protein domain protein  40.4 
 
 		 140 aa  50.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.104439 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4257  PilT domain-containing protein  45 
 
 		 140 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.599841  hitchhiker  0.000155832 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0155  PilT protein domain protein  31.06 
 
 		 139 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.538447 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4014  PilT protein domain protein  30.94 
 
 		 137 aa  47  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00102621  hitchhiker  0.000259631 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4124  PilT domain-containing protein  35.34 
 
 		 128 aa  47.4  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.113441  normal  0.460306 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0354  PilT protein domain protein  32.79 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.279897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2733  PilT protein-like  37.31 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.489446  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1213  PilT domain-containing protein  34.74 
 
 		 143 aa  45.4  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.401096 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1067  PilT protein domain protein  33.85 
 
 		 134 aa  45.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2084  PilT protein-like protein  35.71 
 
 		 135 aa  45.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.236876  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2339  PilT protein domain protein  30.77 
 
 		 141 aa  45.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0602  PilT protein domain protein  36.63 
 
 		 135 aa  45.1  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.191075  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4210  PilT domain-containing protein  39.81 
 
 		 146 aa  44.3  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.242184  normal  0.98897 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5181  PilT domain-containing protein  38.61 
 
 		 136 aa  44.3  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895046  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5262  PilT protein domain protein  37.37 
 
 		 142 aa  44.3  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0679342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0638  PilT protein domain protein  32.31 
 
 		 136 aa  43.9  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0478  virulence-associated protein, putative  32.31 
 
 		 134 aa  43.9  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4182  PilT domain-containing protein  38.38 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0624  PilT protein-like  38.83 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.810517  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4565  PilT protein domain protein  35.29 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2539  PilT domain-containing protein  36.63 
 
 		 136 aa  43.5  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.948556 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4833  PilT protein-like  38.38 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2039  PilT domain-containing protein  38 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.837298  normal  0.704455 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3333  PilT domain-containing protein  38.38 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1533  PilT protein domain protein  31.73 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0497484  hitchhiker  0.000597174 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6402  PilT protein domain protein  32 
 
 		 141 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4284  prevent-host-death protein  38.14 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.600657  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1623  virulence associated protein VagD, putative  35.64 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4574  PilT domain-containing protein  32.85 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0680986  normal  0.0209411 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1063  PilT protein domain protein  35.04 
 
 		 139 aa  42  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.471234  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4028  PilT protein domain protein  35.78 
 
 		 141 aa  42  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0091  PilT domain-containing protein  31.63 
 
 		 132 aa  41.6  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2873  PilT protein domain protein  32.32 
 
 		 135 aa  41.6  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0013  PilT protein-like  40.38 
 
 		 140 aa  41.6  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0630  PilT protein domain protein  33.03 
 
 		 137 aa  41.2  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.317071 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1362  plasmid stability protein, putative  44.07 
 
 		 142 aa  40.8  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00298137  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2936  PilT domain-containing protein  31.06 
 
 		 130 aa  40.8  0.007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.203821 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6277  PilT protein domain protein  33.33 
 
 		 135 aa  40.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.466445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2934  PilT protein-like  36.79 
 
 		 144 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.119744  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>