37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0141 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0141  PilT protein-like  100 
 
 		 157 aa  314  4e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3326  PilT domain-containing protein  60 
 
 		 143 aa  152  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1765  PilT protein domain protein  60.43 
 
 		 142 aa  145  2.0000000000000003e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0806025  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3714  PilT protein domain protein  45.86 
 
 		 139 aa  105  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.440396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0552  PilT domain-containing protein  41.61 
 
 		 127 aa  95.5  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4109  PilT protein-like  42.34 
 
 		 127 aa  95.5  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1540  PilT protein domain protein  40.43 
 
 		 137 aa  84  7e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5572  PilT domain-containing protein  40.88 
 
 		 126 aa  81.6  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0396621  normal  0.199506 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4396  PilT protein domain protein  42.75 
 
 		 125 aa  81.3  0.000000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3106  PilT domain-containing protein  43.07 
 
 		 127 aa  80.1  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.194845  normal  0.285105 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2620  PilT protein domain protein  39.01 
 
 		 134 aa  66.2  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3224  PilT domain-containing protein  41.24 
 
 		 100 aa  61.2  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.418408 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10638  hypothetical protein  33.81 
 
 		 135 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000594146  normal  0.603416 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3212  PilT protein domain protein  35.21 
 
 		 128 aa  54.7  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0181493  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2951  PilT domain-containing protein  32.31 
 
 		 136 aa  50.8  0.000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2150  PilT protein-like  36.17 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2016  hypothetical protein  33.9 
 
 		 112 aa  47.8  0.00006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1325  nucleic acid binding protein  32.82 
 
 		 133 aa  47.4  0.00008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.000000000000354508  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10678  hypothetical protein  33.9 
 
 		 112 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4819  PilT protein domain protein  32.31 
 
 		 127 aa  45.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2777  PilT protein domain protein  33.08 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2534  PilT protein, N-terminal  30.88 
 
 		 137 aa  45.4  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.641844  normal  0.62652 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1623  virulence associated protein VagD, putative  34.78 
 
 		 134 aa  45.4  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4538  PilT protein domain protein  31.62 
 
 		 140 aa  45.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.104439 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0688  PilT domain-containing protein  28.46 
 
 		 132 aa  44.3  0.0007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.442109  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0638  PilT protein domain protein  28.78 
 
 		 136 aa  43.5  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0478  virulence-associated protein, putative  28.78 
 
 		 134 aa  43.5  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1197  PilT domain-containing protein  28.21 
 
 		 187 aa  43.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.814698  normal  0.467575 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3962  PilT domain-containing protein  31.11 
 
 		 137 aa  43.1  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1997 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0354  PilT protein domain protein  40 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.279897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2733  PilT protein-like  40.85 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.489446  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2472  virulence associated protein C  29.93 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00148493  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2873  PilT protein domain protein  30.71 
 
 		 135 aa  42.4  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5170  PilT protein domain protein  33.57 
 
 		 147 aa  41.6  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0469  PilT domain-containing protein  31.01 
 
 		 141 aa  41.6  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8106  PilT protein domain protein  27.56 
 
 		 138 aa  40.4  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4574  PilT domain-containing protein  28.47 
 
 		 147 aa  40.4  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0680986  normal  0.0209411 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>