57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3326 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3326  PilT domain-containing protein  100 
 
 		 143 aa  283  7e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1765  PilT protein domain protein  64.08 
 
 		 142 aa  163  8e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0806025  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0141  PilT protein-like  60 
 
 		 157 aa  152  1e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3714  PilT protein domain protein  49.65 
 
 		 139 aa  113  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.440396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0552  PilT domain-containing protein  41.35 
 
 		 127 aa  88.2  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4109  PilT protein-like  42.11 
 
 		 127 aa  87  7e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1540  PilT protein domain protein  44.78 
 
 		 137 aa  84.7  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4396  PilT protein domain protein  39.84 
 
 		 125 aa  72  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3106  PilT domain-containing protein  42.22 
 
 		 127 aa  72  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.194845  normal  0.285105 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5572  PilT domain-containing protein  42.86 
 
 		 126 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0396621  normal  0.199506 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3224  PilT domain-containing protein  50.54 
 
 		 100 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.418408 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2620  PilT protein domain protein  38.97 
 
 		 134 aa  65.5  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0688  PilT domain-containing protein  28.57 
 
 		 132 aa  53.9  0.0000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.442109  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1127  PilT domain-containing protein  35.66 
 
 		 133 aa  53.5  0.0000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.539233 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5841  PilT domain-containing protein  35.71 
 
 		 141 aa  53.1  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0038  PilT domain-containing protein  31.5 
 
 		 146 aa  52.8  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3212  PilT protein domain protein  36.57 
 
 		 128 aa  51.2  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0181493  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10607  hypothetical protein  37.69 
 
 		 130 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.353151 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10638  hypothetical protein  35.07 
 
 		 135 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000594146  normal  0.603416 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4210  PilT domain-containing protein  34.93 
 
 		 146 aa  48.9  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.242184  normal  0.98897 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3474  PilT domain-containing protein  36.57 
 
 		 141 aa  47.4  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26779 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5055  PilT domain-containing protein  34.04 
 
 		 133 aa  47.4  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2777  PilT protein domain protein  26.95 
 
 		 134 aa  47.4  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0138  PilT domain-containing protein  32.87 
 
 		 133 aa  47  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3320  PilT protein-like  34.03 
 
 		 133 aa  47  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2951  PilT domain-containing protein  30.71 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36180  PilT domain-containing protein  30.28 
 
 		 136 aa  45.4  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2150  PilT protein-like  40.66 
 
 		 133 aa  45.8  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3269  PilT protein-like  30.94 
 
 		 133 aa  46.2  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159462  hitchhiker  0.00995267 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2733  PilT protein-like  33.12 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.489446  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0074  PilT protein domain protein  35.51 
 
 		 139 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3939  PilT protein domain protein  30.94 
 
 		 133 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3569  PilT protein domain protein  33.11 
 
 		 140 aa  44.7  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3767  PilT domain-containing protein  35 
 
 		 140 aa  44.7  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.546918  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0459  PilT protein domain protein  37.4 
 
 		 137 aa  44.7  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.063195 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3988  PilT protein domain protein  30.94 
 
 		 133 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0532731 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1623  virulence associated protein VagD, putative  33.33 
 
 		 134 aa  44.3  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3346  PilT protein-like  36.36 
 
 		 146 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.732175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0701  PilT protein domain protein  31.65 
 
 		 136 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.528227 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2534  PilT protein, N-terminal  31.3 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.641844  normal  0.62652 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1868  PilT domain-containing protein  27.86 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000212984  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2016  hypothetical protein  33.04 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5170  PilT protein domain protein  32.37 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4019  PilT protein-like  32.37 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.506281 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1823  PilT domain-containing protein  33.98 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.402154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0638  PilT protein domain protein  28.67 
 
 		 136 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1545  plasmid stabilization protein StbB-like  33.65 
 
 		 151 aa  42  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00762824 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2669  PilT protein-like  27.54 
 
 		 132 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0691561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1325  nucleic acid binding protein  26.09 
 
 		 133 aa  41.6  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.000000000000354508  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2472  virulence associated protein C  29.29 
 
 		 133 aa  42  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00148493  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0478  virulence-associated protein, putative  28.67 
 
 		 134 aa  41.6  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3902  PilT domain-containing protein  36.27 
 
 		 136 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4364  PilT domain-containing protein  36.27 
 
 		 136 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4425  PilT domain-containing protein  34.82 
 
 		 134 aa  40.8  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00042868 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4710  PilT domain-containing protein  33.33 
 
 		 139 aa  40.4  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.552962 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0154  PilT domain-containing protein  32.87 
 
 		 133 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0091  PilT protein-like  34.13 
 
 		 144 aa  40  0.009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>