60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4109 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4109  PilT protein-like  100 
 
 		 127 aa  244  2e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0552  PilT domain-containing protein  95.28 
 
 		 127 aa  237  2.9999999999999997e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3106  PilT domain-containing protein  78.74 
 
 		 127 aa  185  2e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.194845  normal  0.285105 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5572  PilT domain-containing protein  61.6 
 
 		 126 aa  142  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0396621  normal  0.199506 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0141  PilT protein-like  42.34 
 
 		 157 aa  95.5  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3326  PilT domain-containing protein  42.11 
 
 		 143 aa  87  7e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3714  PilT protein domain protein  42.28 
 
 		 139 aa  84.3  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.440396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4396  PilT protein domain protein  41.13 
 
 		 125 aa  82.4  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3212  PilT protein domain protein  43.09 
 
 		 128 aa  81.3  0.000000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0181493  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1540  PilT protein domain protein  42.31 
 
 		 137 aa  79.7  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1765  PilT protein domain protein  40.3 
 
 		 142 aa  79.3  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0806025  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2620  PilT protein domain protein  38.17 
 
 		 134 aa  70.1  0.000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10638  hypothetical protein  40.16 
 
 		 135 aa  67  0.00000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000594146  normal  0.603416 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0038  PilT domain-containing protein  34.15 
 
 		 146 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4470  ABC transporter related  83.33 
 
 		 183 aa  63.2  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10607  hypothetical protein  35.11 
 
 		 130 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.353151 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2016  hypothetical protein  42.59 
 
 		 112 aa  62.4  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4819  PilT protein domain protein  38.79 
 
 		 127 aa  59.7  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10678  hypothetical protein  40.2 
 
 		 112 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2150  PilT protein-like  37.62 
 
 		 133 aa  53.5  0.0000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2733  PilT protein-like  39.26 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.489446  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2084  PilT protein-like protein  39.36 
 
 		 135 aa  51.6  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.236876  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4014  PilT protein domain protein  32.29 
 
 		 137 aa  49.7  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00102621  hitchhiker  0.000259631 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4538  PilT protein domain protein  37.37 
 
 		 140 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.104439 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4124  PilT domain-containing protein  36.59 
 
 		 128 aa  48.1  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.113441  normal  0.460306 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0354  PilT protein domain protein  32.77 
 
 		 134 aa  47.4  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.279897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0638  PilT protein domain protein  36 
 
 		 136 aa  47.4  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0602  PilT protein domain protein  36.84 
 
 		 135 aa  47.4  0.00007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.191075  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0478  virulence-associated protein, putative  36 
 
 		 134 aa  47.4  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4257  PilT domain-containing protein  38.46 
 
 		 140 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.599841  hitchhiker  0.000155832 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2366  PilT protein domain protein  43.04 
 
 		 137 aa  46.2  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1127  PilT domain-containing protein  38.54 
 
 		 133 aa  47  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.539233 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2873  PilT protein domain protein  33.33 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3697  PilT protein domain protein  39.6 
 
 		 138 aa  45.4  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2934  PilT protein-like  35.29 
 
 		 144 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.119744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1823  PilT domain-containing protein  38.24 
 
 		 142 aa  44.3  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.402154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4575  PilT protein-like  38.83 
 
 		 137 aa  44.3  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1213  PilT domain-containing protein  37.5 
 
 		 143 aa  43.9  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.401096 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4581  PilT protein-like  35.05 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.766949  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1623  virulence associated protein VagD, putative  35.64 
 
 		 134 aa  43.5  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2534  PilT protein, N-terminal  30.3 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.641844  normal  0.62652 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5262  PilT protein domain protein  34.02 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0679342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0155  PilT protein domain protein  29.1 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.538447 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2339  PilT protein domain protein  30.23 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1400  PilT protein domain protein  35.11 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.310156 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0444  PilT domain-containing protein  37.39 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0630  PilT protein domain protein  33.94 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.317071 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1533  PilT protein domain protein  31.37 
 
 		 132 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0497484  hitchhiker  0.000597174 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4284  prevent-host-death protein  37.11 
 
 		 145 aa  41.6  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.600657  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4210  PilT domain-containing protein  41.96 
 
 		 146 aa  41.6  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.242184  normal  0.98897 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4710  PilT domain-containing protein  36.54 
 
 		 139 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.552962 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3163  PilT protein domain protein  35.35 
 
 		 139 aa  40.8  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.732092  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1999  PIN domain protein  36.54 
 
 		 150 aa  40.8  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0463072  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4182  PilT domain-containing protein  39.39 
 
 		 139 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3333  PilT domain-containing protein  39.39 
 
 		 139 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4833  PilT protein-like  39.39 
 
 		 139 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0074  PilT protein domain protein  30.3 
 
 		 139 aa  40.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0624  PilT protein-like  34.95 
 
 		 141 aa  40  0.01  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.810517  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1430  hypothetical protein  36 
 
 		 117 aa  40  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.87225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2936  PilT domain-containing protein  32.5 
 
 		 130 aa  40  0.01  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.203821 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>