54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0444 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0444  PilT domain-containing protein  100 
 
 		 133 aa  250  5.000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0459  PilT protein domain protein  49.6 
 
 		 137 aa  87.4  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.063195 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2826  PilT protein-like  35.34 
 
 		 135 aa  61.6  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.640016  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2951  PilT domain-containing protein  33.33 
 
 		 136 aa  58.2  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3368  plasmid maintenance protein  29.85 
 
 		 133 aa  57.8  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1540  PilT protein domain protein  39.83 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3267  plasmid maintenance protein  29.77 
 
 		 132 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10638  hypothetical protein  39.84 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000594146  normal  0.603416 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0152  PilT protein domain protein  33.86 
 
 		 134 aa  54.7  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2669  PilT protein-like  30 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0691561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2777  PilT protein domain protein  28.89 
 
 		 134 aa  51.2  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1533  PilT protein domain protein  31.01 
 
 		 132 aa  51.2  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0497484  hitchhiker  0.000597174 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0688  PilT domain-containing protein  29.63 
 
 		 132 aa  51.6  0.000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.442109  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2129  virulence-associated protein, putative  27.94 
 
 		 136 aa  50.8  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0156283  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1788  PilT protein domain protein  27.94 
 
 		 136 aa  50.8  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.813085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1484  hypothetical protein  28.46 
 
 		 141 aa  49.7  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.174904  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0552  PilT domain-containing protein  37.39 
 
 		 127 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4109  PilT protein-like  37.39 
 
 		 127 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0440  PilT protein-like  30.37 
 
 		 134 aa  48.9  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000179252  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03915  predicted nucleic acid-binding protein,contains PIN domain  35.29 
 
 		 101 aa  47.4  0.00006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.968864  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1771  hypothetical protein  27.41 
 
 		 133 aa  47.4  0.00007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3680  PilT protein domain protein  26.72 
 
 		 134 aa  47  0.00009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1325  nucleic acid binding protein  30.08 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.000000000000354508  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1461  PilT protein domain protein  26.67 
 
 		 134 aa  45.4  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1045  virulence-associated protein, putative  29.17 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.491192  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0638  PilT protein domain protein  30.71 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0478  virulence-associated protein, putative  30.65 
 
 		 134 aa  45.4  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3988  PilT protein domain protein  32.06 
 
 		 133 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0532731 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4014  PilT protein domain protein  30.47 
 
 		 137 aa  45.1  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00102621  hitchhiker  0.000259631 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0894  PilT protein, N-terminal  28.24 
 
 		 134 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.282292 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0602  PilT protein domain protein  32.5 
 
 		 135 aa  45.1  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.191075  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1868  PilT domain-containing protein  26.32 
 
 		 133 aa  44.7  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000212984  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3905  PilT domain-containing protein  28.89 
 
 		 134 aa  44.7  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.646522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1823  PilT domain-containing protein  30.77 
 
 		 142 aa  43.9  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.402154  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2472  virulence associated protein C  24.81 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00148493  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1337  PilT protein domain protein  30.58 
 
 		 129 aa  43.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.1325  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8106  PilT protein domain protein  29.75 
 
 		 138 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0898  PilT protein domain protein  33.01 
 
 		 131 aa  42.4  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.185586  normal  0.0272728 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1876  PilT protein domain protein  28.91 
 
 		 129 aa  42  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3106  PilT domain-containing protein  36.52 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.194845  normal  0.285105 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1623  virulence associated protein VagD, putative  33.85 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1840  PilT domain-containing protein  24.35 
 
 		 135 aa  42  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1765  PilT protein domain protein  34.31 
 
 		 142 aa  42  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0806025  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3212  PilT protein domain protein  30.91 
 
 		 128 aa  42  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0181493  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3767  PilT domain-containing protein  32.8 
 
 		 140 aa  42  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.546918  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3939  PilT protein domain protein  32.48 
 
 		 133 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1400  PilT protein domain protein  31.4 
 
 		 140 aa  41.6  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.310156 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2366  PilT protein domain protein  30.89 
 
 		 137 aa  41.2  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1627  PilT protein domain protein  30.37 
 
 		 136 aa  41.2  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.733144  normal  0.420461 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0505  putative plasmid stability protein  33.07 
 
 		 145 aa  41.6  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.294814 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2719  PilT protein-like  25.74 
 
 		 151 aa  41.6  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.116591 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3732  nucleic acid-binding protein  28.12 
 
 		 132 aa  41.2  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2302  plasmid stabilization protein  30.08 
 
 		 142 aa  40.4  0.007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.171886  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2505  PilT protein domain protein  30.89 
 
 		 142 aa  40  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>