65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0552 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0552  PilT domain-containing protein  100 
 
 		 127 aa  247  4e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4109  PilT protein-like  95.28 
 
 		 127 aa  237  2.9999999999999997e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3106  PilT domain-containing protein  80.31 
 
 		 127 aa  185  2e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.194845  normal  0.285105 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5572  PilT domain-containing protein  63.2 
 
 		 126 aa  147  7e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0396621  normal  0.199506 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0141  PilT protein-like  41.61 
 
 		 157 aa  95.5  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3326  PilT domain-containing protein  41.35 
 
 		 143 aa  88.2  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3714  PilT protein domain protein  41.13 
 
 		 139 aa  85.1  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.440396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4396  PilT protein domain protein  40.32 
 
 		 125 aa  83.2  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3212  PilT protein domain protein  42.28 
 
 		 128 aa  81.6  0.000000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0181493  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1765  PilT protein domain protein  40.15 
 
 		 142 aa  80.5  0.000000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0806025  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1540  PilT protein domain protein  40.91 
 
 		 137 aa  77.8  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2620  PilT protein domain protein  37.88 
 
 		 134 aa  72.4  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10638  hypothetical protein  40.16 
 
 		 135 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000594146  normal  0.603416 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0038  PilT domain-containing protein  35.77 
 
 		 146 aa  67  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10607  hypothetical protein  37.04 
 
 		 130 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.353151 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2016  hypothetical protein  40.74 
 
 		 112 aa  62.4  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4470  ABC transporter related  78.95 
 
 		 183 aa  61.6  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4819  PilT protein domain protein  37.93 
 
 		 127 aa  58.9  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10678  hypothetical protein  38.24 
 
 		 112 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2733  PilT protein-like  39.39 
 
 		 145 aa  53.5  0.0000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.489446  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2150  PilT protein-like  37.62 
 
 		 133 aa  53.5  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2084  PilT protein-like protein  38.3 
 
 		 135 aa  52.4  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.236876  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4014  PilT protein domain protein  29.85 
 
 		 137 aa  51.6  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00102621  hitchhiker  0.000259631 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0638  PilT protein domain protein  36 
 
 		 136 aa  49.7  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0478  virulence-associated protein, putative  36 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2366  PilT protein domain protein  42.53 
 
 		 137 aa  48.9  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4538  PilT protein domain protein  34.02 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.104439 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1127  PilT domain-containing protein  37.5 
 
 		 133 aa  48.1  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.539233 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4124  PilT domain-containing protein  34.96 
 
 		 128 aa  47.8  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.113441  normal  0.460306 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0354  PilT protein domain protein  32.77 
 
 		 134 aa  47.4  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.279897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0602  PilT protein domain protein  35.79 
 
 		 135 aa  47.4  0.00007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.191075  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4257  PilT domain-containing protein  43.56 
 
 		 140 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.599841  hitchhiker  0.000155832 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3697  PilT protein domain protein  38.61 
 
 		 138 aa  46.2  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1623  virulence associated protein VagD, putative  36.63 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2339  PilT protein domain protein  29.46 
 
 		 141 aa  44.3  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5262  PilT protein domain protein  34.34 
 
 		 142 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0679342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0444  PilT domain-containing protein  37.39 
 
 		 133 aa  44.3  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4575  PilT protein-like  37.86 
 
 		 137 aa  44.3  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4284  prevent-host-death protein  38.14 
 
 		 145 aa  43.9  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.600657  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4210  PilT domain-containing protein  39.81 
 
 		 146 aa  43.9  0.0008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.242184  normal  0.98897 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0630  PilT protein domain protein  33.03 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.317071 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2873  PilT protein domain protein  31.31 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0074  PilT protein domain protein  31.31 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1533  PilT protein domain protein  31.37 
 
 		 132 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0497484  hitchhiker  0.000597174 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0624  PilT protein-like  36.89 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.810517  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2934  PilT protein-like  34.65 
 
 		 144 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.119744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0013  PilT protein-like  38.24 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1823  PilT domain-containing protein  33.67 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.402154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4581  PilT protein-like  34.02 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.766949  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4710  PilT domain-containing protein  36.54 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.552962 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1400  PilT protein domain protein  37.11 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.310156 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2534  PilT protein, N-terminal  31.58 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.641844  normal  0.62652 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1213  PilT domain-containing protein  34.38 
 
 		 143 aa  42.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.401096 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0896  PilT protein-like  36.08 
 
 		 139 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3163  PilT protein domain protein  36.36 
 
 		 139 aa  42  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.732092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3333  PilT domain-containing protein  38.38 
 
 		 139 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4833  PilT protein-like  38.38 
 
 		 139 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4182  PilT domain-containing protein  38.38 
 
 		 139 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0469  PilT domain-containing protein  34.17 
 
 		 141 aa  41.2  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1430  hypothetical protein  35 
 
 		 117 aa  41.2  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.87225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4188  PilT domain-containing protein  36.54 
 
 		 139 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.990127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5884  PilT domain-containing protein  39.6 
 
 		 148 aa  40.8  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.669409 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0155  PilT protein domain protein  27.07 
 
 		 139 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.538447 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2039  PilT domain-containing protein  38.61 
 
 		 140 aa  40.4  0.008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.837298  normal  0.704455 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1999  PIN domain protein  35.58 
 
 		 150 aa  40  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0463072  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>