More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4470 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4470  ABC transporter related  100 
 
 		 183 aa  363  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1781  ABC transporter related  48.03 
 
 		 503 aa  129  3e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000368661  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2321  ABC transporter related  53.6 
 
 		 533 aa  129  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.640938 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0838  ABC transporter related protein  51.2 
 
 		 516 aa  128  4.0000000000000003e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.624607  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1938  ABC transporter, fused ATPase subunits  53.6 
 
 		 533 aa  127  6e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.633087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1291  ABC transporter related  53.6 
 
 		 539 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3903  ABC transporter related  53.54 
 
 		 511 aa  126  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1138  ABC transporter related  48.84 
 
 		 547 aa  126  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1211  ABC transporter related  51.54 
 
 		 524 aa  125  3e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000459128 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1952  ABC transporter related  53.17 
 
 		 505 aa  125  3e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00677494 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4147  ABC transporter related  54.62 
 
 		 524 aa  125  3e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0803  putative sugar ATP binding ABC transporter protein  52.76 
 
 		 509 aa  125  3e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1926  ABC transporter related  52.03 
 
 		 517 aa  124  5e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.748491 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3457  ABC transporter-related protein  51.97 
 
 		 519 aa  123  1e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.244648 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2498  ABC transporter related  50.39 
 
 		 524 aa  123  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0857  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  49.6 
 
 		 512 aa  123  2e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0797  ABC transporter-related protein  50.39 
 
 		 537 aa  122  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.655156 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0073  ABC-type uncharacterized transport systems, ATPase component  47.58 
 
 		 518 aa  122  3e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1357  ABC transporter related  56.3 
 
 		 531 aa  122  3e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3101  ABC transporter related  51.97 
 
 		 533 aa  122  3e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2376  ABC transporter related  51.18 
 
 		 504 aa  122  4e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.390986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07930  nucleoside ABC transporter ATP-binding protein  49.59 
 
 		 534 aa  122  4e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1483  ABC transporter related  51.97 
 
 		 514 aa  121  5e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0560385 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1976  ABC transporter related  48.84 
 
 		 516 aa  121  5e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2990  ABC transporter related  50.38 
 
 		 513 aa  121  7e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0926218 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1949  ABC transporter, ATP-binding protein  43.9 
 
 		 507 aa  120  8e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.740579  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0825  ABC transporter related  47.66 
 
 		 527 aa  120  9.999999999999999e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.523889  normal  0.712495 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2447  ABC transporter related  51.18 
 
 		 533 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1036  ABC transporter related  50.39 
 
 		 524 aa  120  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0725845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1005  ABC transporter, ATPase subunit  52.76 
 
 		 512 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01670  putative ATP-binding component of ABC transporter  55.74 
 
 		 523 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000256924  normal  0.788807 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2173  sugar ATP binding ABC transporter protein  49.22 
 
 		 508 aa  119  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.83271  normal  0.995047 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1063  ABC transporter-related protein  52.76 
 
 		 512 aa  118  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.83963  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1900  ABC transporter related  50.39 
 
 		 522 aa  118  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.948331  normal  0.18813 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1410  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  47.2 
 
 		 510 aa  118  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0297132  hitchhiker  0.00935726 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1418  ABC transporter related  50.39 
 
 		 544 aa  118  4.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.069949  normal  0.112153 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0673  ABC transporter  48.8 
 
 		 517 aa  118  6e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.918882  normal  0.379725 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1066  ABC transporter related  51.97 
 
 		 512 aa  118  6e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1716  ABC transporter related  49.61 
 
 		 522 aa  117  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3173  ABC transporter related  51.97 
 
 		 512 aa  117  7e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.590502  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1021  ABC transporter related protein  48.06 
 
 		 505 aa  117  7e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.728711 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3803  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  45.97 
 
 		 510 aa  117  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000201894 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3642  sugar ABC transporter ATP-binding protein  45.97 
 
 		 508 aa  117  7.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3532  ABC transporter, ATP-binding protein  45.97 
 
 		 510 aa  117  7.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.664818  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3550  ABC transporter, ATP-binding protein  45.97 
 
 		 510 aa  117  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0119888  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3926  sugar ABC transporter ATP-binding protein  45.97 
 
 		 510 aa  117  7.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0557636  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2166  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  50.78 
 
 		 532 aa  117  7.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2135  ABC transporter related  48.82 
 
 		 533 aa  117  9e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.597134  normal  0.305125 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0402  ABC transporter related  45.67 
 
 		 509 aa  117  9e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.351513  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3825  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  45.97 
 
 		 510 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.37688  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0769  ABC transporter, ATP-binding protein  48.8 
 
 		 517 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3838  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  45.97 
 
 		 510 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00178952  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0681  ABC transporter-like  50.79 
 
 		 516 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000167048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0504  ABC transporter related protein  44.8 
 
 		 506 aa  116  9.999999999999999e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2060  putative ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 		 522 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.31936 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08780  ABC transporter related  45.97 
 
 		 513 aa  116  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000334619  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2768  ABC transporter related  43.75 
 
 		 510 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3561  ABC transporter related  46.4 
 
 		 510 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00305644  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1132  ABC transporter-related protein  50.39 
 
 		 504 aa  116  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709072 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1579  ABC transporter related protein  46.77 
 
 		 520 aa  116  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1177  ABC transporter related  46.67 
 
 		 509 aa  115  3e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2442  ABC transporter-related protein  46.4 
 
 		 510 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0142053  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0934  ABC transporter related  49.6 
 
 		 505 aa  115  3.9999999999999997e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0331703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2258  ABC transporter related  46.28 
 
 		 514 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0334051  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3889  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  45.6 
 
 		 510 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.228489  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1244  ABC transporter related  50.41 
 
 		 533 aa  114  6e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.21787 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3268  ABC transporter related  46.28 
 
 		 520 aa  114  6e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00516012  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0213  ABC transporter ATP-binding protein  53.72 
 
 		 523 aa  114  6e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0557881  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0756  ABC transporter related  44.35 
 
 		 509 aa  114  6.9999999999999995e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2077  ABC transporter related  50.41 
 
 		 529 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0945208 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1353  ABC transporter related protein  50 
 
 		 516 aa  114  6.9999999999999995e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25750  nucleoside ABC transporter ATP-binding protein  48.09 
 
 		 522 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.342553  normal  0.485424 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1905  ABC transporter component  48.8 
 
 		 530 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3166  ABC transporter related  48.03 
 
 		 508 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.539119  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1452  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  46.67 
 
 		 506 aa  114  1.0000000000000001e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00705254  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1317  ABC transporter related  49.19 
 
 		 525 aa  114  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2069  ABC transporter related protein  47.2 
 
 		 508 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3557  ABC transporter ATPase  53.72 
 
 		 507 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.419368  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3945  hypothetical protein  53.72 
 
 		 506 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.136005  normal  0.317773 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1407  ABC transporter related  42.28 
 
 		 509 aa  112  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00366651  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3051  ABC transporter related  46.83 
 
 		 511 aa  112  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6464  ABC transporter related  49.6 
 
 		 506 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.51387  normal  0.933482 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0017  ABC transporter related  44.35 
 
 		 507 aa  112  3e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2599  ABC transporter-like  44.72 
 
 		 491 aa  112  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.766453  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04900  ATPase component of uncharacterized ABC-type transporter  48.84 
 
 		 532 aa  112  3e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21270  nucleoside ABC transporter ATP-binding protein  46.88 
 
 		 523 aa  112  3e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.255586  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0156  ABC transporter related  49.19 
 
 		 518 aa  112  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3240  ABC transporter related  53.72 
 
 		 507 aa  112  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0754333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2961  ABC transporter ATP binding protein  50.4 
 
 		 511 aa  112  4.0000000000000004e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.143665 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1607  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  43.55 
 
 		 528 aa  112  4.0000000000000004e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5003  ABC transporter related  48.82 
 
 		 527 aa  112  4.0000000000000004e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1831  ABC transporter, ATP-binding protein  44.26 
 
 		 511 aa  111  5e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.567476  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1634  ABC transporter related  50.81 
 
 		 527 aa  111  6e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487663 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0143  ABC transporter related  45.16 
 
 		 509 aa  111  7.000000000000001e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1121  ABC transporter related  50.39 
 
 		 539 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0474016  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0570  ABC transporter, ATP-binding protein  49.6 
 
 		 520 aa  110  9e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0496  ABC transporter related  50.4 
 
 		 506 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0969653 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1551  sugar ABC transporter ATP-binding protein  42.62 
 
 		 511 aa  110  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.048612  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0677  ABC transporter-like protein  45.6 
 
 		 503 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.366203 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3632  ABC transporter related  48 
 
 		 520 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>