24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4396 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_4396  PilT protein domain protein  100 
 
 		 125 aa  243  4.9999999999999997e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0552  PilT domain-containing protein  40.32 
 
 		 127 aa  83.2  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4109  PilT protein-like  41.13 
 
 		 127 aa  82.4  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0141  PilT protein-like  42.75 
 
 		 157 aa  81.3  0.000000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5572  PilT domain-containing protein  45.83 
 
 		 126 aa  80.9  0.000000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0396621  normal  0.199506 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3106  PilT domain-containing protein  45.16 
 
 		 127 aa  77  0.00000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.194845  normal  0.285105 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3326  PilT domain-containing protein  39.84 
 
 		 143 aa  72  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1765  PilT protein domain protein  37.88 
 
 		 142 aa  69.3  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0806025  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2620  PilT protein domain protein  35.94 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2150  PilT protein-like  33.05 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3714  PilT protein domain protein  36.11 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.440396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0354  PilT protein domain protein  38.66 
 
 		 134 aa  51.2  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.279897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1400  PilT protein domain protein  34.09 
 
 		 140 aa  48.9  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.310156 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1540  PilT protein domain protein  38.1 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4819  PilT protein domain protein  37.98 
 
 		 127 aa  46.2  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1823  PilT domain-containing protein  36.36 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.402154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3212  PilT protein domain protein  37.01 
 
 		 128 aa  45.4  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0181493  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4014  PilT protein domain protein  32.06 
 
 		 137 aa  45.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00102621  hitchhiker  0.000259631 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2951  PilT domain-containing protein  31.06 
 
 		 136 aa  44.7  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1663  PilT protein-like  30.95 
 
 		 120 aa  44.7  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0881523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5170  PilT protein domain protein  31.16 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10607  hypothetical protein  39 
 
 		 130 aa  42.7  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.353151 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2733  PilT protein-like  35.71 
 
 		 145 aa  42.7  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.489446  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0442  nitrogen regulatory protein NtrR  34.09 
 
 		 134 aa  40.4  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.315733  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>