37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10607 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10607  hypothetical protein  100 
 
 
130 aa  260  4e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.353151 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10638  hypothetical protein  40.77 
 
 
135 aa  81.3  0.000000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000594146  normal  0.603416 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4819  PilT protein domain protein  41.54 
 
 
127 aa  66.2  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0552  PilT domain-containing protein  37.04 
 
 
127 aa  65.9  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3212  PilT protein domain protein  36.28 
 
 
128 aa  63.5  0.0000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0181493  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4109  PilT protein-like  35.11 
 
 
127 aa  63.2  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0305  PilT protein domain protein  32.26 
 
 
128 aa  62.8  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0032427  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2016  hypothetical protein  38.68 
 
 
112 aa  60.5  0.000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10678  hypothetical protein  42.31 
 
 
112 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3106  PilT domain-containing protein  37.69 
 
 
127 aa  52  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.194845  normal  0.285105 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1812  PilT domain-containing protein  27.78 
 
 
132 aa  51.2  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.034692  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3326  PilT domain-containing protein  37.69 
 
 
143 aa  50.4  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0038  PilT domain-containing protein  27.91 
 
 
146 aa  50.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0713  PilT domain-containing protein  35.23 
 
 
141 aa  47.4  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000185206  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2934  PilT protein-like  36.08 
 
 
144 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.119744  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3474  PilT domain-containing protein  34.07 
 
 
141 aa  44.7  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.26779 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1840  PilT domain-containing protein  25.81 
 
 
135 aa  44.7  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1904  PilT protein domain protein  26.5 
 
 
129 aa  44.3  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.101114 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4710  PilT domain-containing protein  35.56 
 
 
139 aa  44.3  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.552962 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1337  PilT protein domain protein  24.21 
 
 
129 aa  44.7  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.1325  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2472  virulence associated protein C  28.03 
 
 
133 aa  43.9  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00148493  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1868  PilT domain-containing protein  27.27 
 
 
133 aa  43.9  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000212984  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4188  PilT domain-containing protein  35.56 
 
 
139 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.990127  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0896  PilT protein-like  34.44 
 
 
139 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1400  PilT protein domain protein  37.5 
 
 
140 aa  43.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.310156 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4396  PilT protein domain protein  39 
 
 
125 aa  42.7  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2505  PilT protein-like  27.03 
 
 
147 aa  42.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00228638  normal  0.384652 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2936  PilT domain-containing protein  26.89 
 
 
130 aa  42  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.203821 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4538  PilT protein domain protein  31.5 
 
 
140 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.104439 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1848  PilT protein domain protein  24.74 
 
 
129 aa  41.6  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5841  PilT domain-containing protein  31.87 
 
 
141 aa  41.2  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3767  PilT domain-containing protein  34.07 
 
 
140 aa  40.8  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.546918  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4425  PilT domain-containing protein  33.67 
 
 
134 aa  40.8  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00042868 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2719  PilT protein-like  30.65 
 
 
151 aa  40.8  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.116591 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4008  putative PilT-like protein  34 
 
 
163 aa  40.4  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2534  PilT protein, N-terminal  34.04 
 
 
137 aa  40.4  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.641844  normal  0.62652 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0018  plasmid stability protein StbB  34.07 
 
 
139 aa  40.4  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0242004  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>