63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0038 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0038  PilT domain-containing protein  100 
 
 		 146 aa  301  2.0000000000000002e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4257  PilT domain-containing protein  40.15 
 
 		 140 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.599841  hitchhiker  0.000155832 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0552  PilT domain-containing protein  35.77 
 
 		 127 aa  67  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2936  PilT domain-containing protein  28.15 
 
 		 130 aa  66.6  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.203821 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3106  PilT domain-containing protein  37.4 
 
 		 127 aa  64.3  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.194845  normal  0.285105 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4109  PilT protein-like  34.15 
 
 		 127 aa  63.9  0.0000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4014  PilT protein domain protein  31.88 
 
 		 137 aa  60.8  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00102621  hitchhiker  0.000259631 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1540  PilT protein domain protein  31.54 
 
 		 137 aa  60.1  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0305  PilT protein domain protein  31.25 
 
 		 128 aa  57  0.00000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0032427  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1840  PilT domain-containing protein  28.46 
 
 		 135 aa  53.5  0.0000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5572  PilT domain-containing protein  37.31 
 
 		 126 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0396621  normal  0.199506 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1067  PilT protein domain protein  28.26 
 
 		 134 aa  53.5  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1484  hypothetical protein  27.41 
 
 		 141 aa  53.1  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.174904  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1868  PilT domain-containing protein  31.69 
 
 		 133 aa  52.4  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000212984  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3326  PilT domain-containing protein  31.5 
 
 		 143 aa  52.8  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0478  virulence-associated protein, putative  30 
 
 		 134 aa  52  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0599  PilT domain-containing protein  33.08 
 
 		 128 aa  52  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2472  virulence associated protein C  28.43 
 
 		 133 aa  52  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00148493  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0688  PilT domain-containing protein  29.93 
 
 		 132 aa  51.2  0.000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.442109  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10638  hypothetical protein  27.69 
 
 		 135 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000594146  normal  0.603416 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0638  PilT protein domain protein  29.71 
 
 		 136 aa  50.4  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2468  PilT protein domain protein  29.5 
 
 		 135 aa  50.4  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0500169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0154  PilT domain-containing protein  31.16 
 
 		 133 aa  50.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2777  PilT protein domain protein  27.74 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10607  hypothetical protein  27.91 
 
 		 130 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.353151 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0898  PilT protein domain protein  27.27 
 
 		 131 aa  49.3  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.185586  normal  0.0272728 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2661  PilT domain-containing protein  32.85 
 
 		 124 aa  48.5  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1812  PilT domain-containing protein  28.68 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.034692  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4124  PilT domain-containing protein  31.62 
 
 		 128 aa  48.5  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.113441  normal  0.460306 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1623  virulence associated protein VagD, putative  32.37 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1823  PilT domain-containing protein  27.34 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.402154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1127  PilT domain-containing protein  29.81 
 
 		 133 aa  47.4  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.539233 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4819  PilT protein domain protein  34.15 
 
 		 127 aa  47.4  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0138  PilT domain-containing protein  28.06 
 
 		 133 aa  47  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3905  PilT domain-containing protein  31.03 
 
 		 134 aa  47  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.646522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4147  PilT domain-containing protein  28.36 
 
 		 134 aa  47  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.448502  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36180  PilT domain-containing protein  28.3 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8106  PilT protein domain protein  27.01 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3320  PilT protein-like  29.63 
 
 		 133 aa  46.2  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1400  PilT protein domain protein  29.69 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.310156 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0442  nitrogen regulatory protein NtrR  27.74 
 
 		 134 aa  44.3  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.315733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0505  PilT protein domain protein  26.36 
 
 		 131 aa  43.9  0.0007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3714  PilT protein domain protein  30.77 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.440396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5055  PilT domain-containing protein  31.88 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2332  PilT protein-like  29.09 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.221502 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1319  PilT protein domain protein  28.89 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1325  nucleic acid binding protein  28.16 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.000000000000354508  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0505  putative plasmid stability protein  30.41 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.294814 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3889  PilT domain-containing protein  31.3 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3079  PilT protein-like  30 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.046913  normal  0.55485 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2934  PilT protein-like  29.79 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.119744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1138  PilT domain-containing protein  28.87 
 
 		 133 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0871  putative plasmid stability-like protein  32.14 
 
 		 137 aa  41.6  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.852163  normal  0.0312935 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0152  PilT protein domain protein  27.07 
 
 		 134 aa  41.6  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0012  PilT protein domain-containing protein  30.48 
 
 		 133 aa  41.2  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.948131 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3346  PilT protein-like  27.91 
 
 		 146 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.732175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1063  PilT protein domain protein  28.57 
 
 		 139 aa  41.2  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.471234  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1848  PilT protein domain protein  24.81 
 
 		 129 aa  40.8  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3212  PilT protein domain protein  32.06 
 
 		 128 aa  40.8  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0181493  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4104  PilT protein-like  32.54 
 
 		 140 aa  40.8  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.393493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0286  PilT protein domain protein  28.78 
 
 		 135 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.024358  decreased coverage  0.0024847 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2951  PilT domain-containing protein  29.5 
 
 		 136 aa  40.4  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5766  PilT protein domain protein  26.92 
 
 		 126 aa  40  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.300152  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>