79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5766 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5766  PilT protein domain protein  100 
 
 		 126 aa  254  3e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.300152  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0599  PilT domain-containing protein  40.83 
 
 		 128 aa  85.5  2e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3865  PilT domain-containing protein  34.15 
 
 		 126 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.870941  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1321  PIN domain protein  36.51 
 
 		 130 aa  74.7  0.0000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.282385  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1380  PilT domain-containing protein  36.75 
 
 		 128 aa  74.7  0.0000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.978498  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2343  PilT domain-containing protein  32.77 
 
 		 133 aa  73.6  0.0000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.487913  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0188  PilT protein domain protein  31.15 
 
 		 125 aa  68.9  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2498  PilT protein domain protein  35.77 
 
 		 136 aa  63.9  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0159803 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2659  nucleic acid binding protein  34.92 
 
 		 127 aa  63.2  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.234415  normal  0.629356 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11426  hypothetical protein  37.8 
 
 		 133 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.3127099999999998e-21  normal  0.106237 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12568  hypothetical protein  34.4 
 
 		 125 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.724019  normal  0.141761 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1062  PilT protein-like  36.8 
 
 		 121 aa  57  0.00000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0152  PilT protein domain protein  29.77 
 
 		 134 aa  53.9  0.0000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4420  PilT protein domain protein  30.08 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3572  PilT protein domain protein  31.97 
 
 		 125 aa  52.4  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0051  PilT domain-containing protein  32.76 
 
 		 126 aa  52.8  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.330837 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5055  PilT domain-containing protein  32.81 
 
 		 133 aa  52.4  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0505  PilT protein domain protein  29.6 
 
 		 131 aa  51.2  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2082  PilT protein domain protein  29.75 
 
 		 121 aa  51.6  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.951724  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1533  PilT protein domain protein  31.2 
 
 		 132 aa  51.2  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0497484  hitchhiker  0.000597174 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1777  PilT domain-containing protein  30.5 
 
 		 143 aa  50.8  0.000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.406004  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1443  PilT domain-containing protein  28.91 
 
 		 125 aa  50.8  0.000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0125509  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1382  hypothetical protein  28.91 
 
 		 125 aa  50.8  0.000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000499389  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3461  PilT domain-containing protein  31.01 
 
 		 135 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.999718 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2839  nucleic acid-binding protein contains PIN domain  32 
 
 		 140 aa  50.1  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.454124  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4565  PilT protein domain protein  32.81 
 
 		 140 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4619  PilT domain-containing protein  30.71 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0857  PilT protein  32.8 
 
 		 140 aa  48.5  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.159356 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1484  hypothetical protein  28.57 
 
 		 141 aa  47.8  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.174904  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4829  PilT protein domain protein  28.91 
 
 		 130 aa  47.8  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3757  PilT domain-containing protein  28.24 
 
 		 135 aa  48.1  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00272094  normal  0.0228653 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4130  hypothetical protein  35.71 
 
 		 107 aa  47.4  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5262  PilT protein domain protein  27.78 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0679342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4092  PilT domain-containing protein  31.67 
 
 		 121 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3431  PilT domain-containing protein  31.67 
 
 		 121 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4274  PilT protein-like  31.67 
 
 		 121 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0442  nitrogen regulatory protein NtrR  34.81 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.315733  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3680  PilT protein domain protein  28.91 
 
 		 134 aa  46.2  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1936  PilT protein domain protein  30.69 
 
 		 137 aa  45.4  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4624  PilT domain-containing protein  28.12 
 
 		 136 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.723585  normal  0.112001 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0688  PilT domain-containing protein  30.16 
 
 		 132 aa  46.2  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.442109  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3968  PilT domain-containing protein  30.3 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.10464  normal  0.34904 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1142  nucleic acid-binding protein  29.06 
 
 		 121 aa  45.4  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4581  PilT protein-like  30.95 
 
 		 140 aa  45.4  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.766949  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0681  hypothetical protein  34.26 
 
 		 127 aa  45.1  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000394475  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2951  PilT domain-containing protein  29.37 
 
 		 136 aa  45.1  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0505  putative plasmid stability protein  32.54 
 
 		 145 aa  44.7  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.294814 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4589  PilT protein domain protein  31.85 
 
 		 139 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000022459  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3135  PilT domain-containing protein  24.06 
 
 		 129 aa  44.7  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1389  nucleic acid binding protein  29.13 
 
 		 125 aa  44.7  0.0005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0940077  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0414  PilT protein domain protein  32.28 
 
 		 135 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4147  PilT domain-containing protein  31.01 
 
 		 134 aa  43.9  0.0007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.448502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4187  DNA replication protein-like protein  27.91 
 
 		 135 aa  43.9  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.49294 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1461  PilT protein domain protein  27.78 
 
 		 134 aa  43.9  0.0008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1433  PilT protein domain protein  28.91 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.697875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1183  PilT protein domain protein  29.66 
 
 		 119 aa  43.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2936  PilT domain-containing protein  28.24 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.203821 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4014  PilT protein domain protein  29.01 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00102621  hitchhiker  0.000259631 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1201  PilT protein-like  34.13 
 
 		 121 aa  43.5  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0955216  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3729  PilT protein-like  34.62 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.294534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6219  PilT protein domain protein  28.46 
 
 		 129 aa  42.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.314877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2129  virulence-associated protein, putative  31.25 
 
 		 136 aa  42.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0156283  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4062  PilT protein domain protein  30.37 
 
 		 155 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1788  PilT protein domain protein  31.25 
 
 		 136 aa  42.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.813085  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2127  vapC protein, putative  31.82 
 
 		 133 aa  42  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0656  nucleic acid binding protein  31.53 
 
 		 126 aa  42  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.388004  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5181  PilT domain-containing protein  28.46 
 
 		 136 aa  42  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1048  PilT protein domain protein  44 
 
 		 109 aa  42  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.71366  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1319  PilT protein domain protein  28.91 
 
 		 140 aa  41.6  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4538  PilT protein domain protein  29.69 
 
 		 140 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.104439 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0741  hypothetical protein  32.89 
 
 		 85 aa  40.8  0.007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1627  PilT protein domain protein  26.77 
 
 		 136 aa  40.8  0.007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.733144  normal  0.420461 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1063  PilT protein domain protein  28.36 
 
 		 139 aa  40.8  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.471234  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1159  PilT protein domain protein  30.71 
 
 		 132 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.876268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1067  PilT protein domain protein  27.34 
 
 		 134 aa  40.4  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3267  plasmid maintenance protein  25.98 
 
 		 132 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0286  PilT protein domain protein  29.23 
 
 		 135 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.024358  decreased coverage  0.0024847 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3585  PilT protein domain protein  29.51 
 
 		 129 aa  40  0.01  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1436  hypothetical protein  28.57 
 
 		 97 aa  40  0.01  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000042166  normal  0.0228273 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>