34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3865 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3865  PilT domain-containing protein  100 
 
 		 126 aa  260  4.999999999999999e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.870941  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0188  PilT protein domain protein  74.4 
 
 		 125 aa  201  3e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1086  PilT domain-containing protein  49.43 
 
 		 90 aa  97.1  7e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.174841  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3572  PilT protein domain protein  34.4 
 
 		 125 aa  90.5  8e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1443  PilT domain-containing protein  33.6 
 
 		 125 aa  82.4  0.000000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0125509  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1382  hypothetical protein  33.6 
 
 		 125 aa  82.4  0.000000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000499389  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0599  PilT domain-containing protein  39.5 
 
 		 128 aa  81.3  0.000000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5766  PilT protein domain protein  34.15 
 
 		 126 aa  75.5  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.300152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1321  PIN domain protein  31.45 
 
 		 130 aa  62  0.000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.282385  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1380  PilT domain-containing protein  31.45 
 
 		 128 aa  62  0.000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.978498  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0182  prevent-host-death family protein  73.53 
 
 		 116 aa  60.8  0.000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0439238  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2343  PilT domain-containing protein  30.83 
 
 		 133 aa  54.3  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.487913  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4420  PilT protein domain protein  31.75 
 
 		 128 aa  52.4  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1062  PilT protein-like  28.83 
 
 		 121 aa  50.1  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0505  PilT protein domain protein  25.81 
 
 		 131 aa  49.3  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2498  PilT protein domain protein  30 
 
 		 136 aa  48.9  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0159803 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11426  hypothetical protein  30 
 
 		 133 aa  47  0.00008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.3127099999999998e-21  normal  0.106237 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3135  PilT domain-containing protein  29.37 
 
 		 129 aa  47  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0280  PilT domain-containing protein  31.45 
 
 		 133 aa  44.3  0.0005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.4278  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1142  nucleic acid-binding protein  26.61 
 
 		 121 aa  44.3  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2559  hypothetical protein  38.18 
 
 		 76 aa  43.9  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00885096  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2987  PilT protein domain protein  26.92 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0051  PilT domain-containing protein  26.67 
 
 		 126 aa  42.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.330837 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0414  PilT protein domain protein  23.26 
 
 		 135 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0983  PilT domain-containing protein  21.88 
 
 		 133 aa  42  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12568  hypothetical protein  28.35 
 
 		 125 aa  41.6  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.724019  normal  0.141761 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0688  PilT domain-containing protein  26.05 
 
 		 132 aa  42  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.442109  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0420  PilT protein domain protein  27.21 
 
 		 137 aa  41.6  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2082  PilT protein domain protein  24.55 
 
 		 121 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.951724  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2468  PilT protein domain protein  28.69 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0500169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4092  PilT domain-containing protein  26.79 
 
 		 121 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4274  PilT protein-like  26.79 
 
 		 121 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3431  PilT domain-containing protein  26.79 
 
 		 121 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1183  PilT protein domain protein  25.62 
 
 		 119 aa  40  0.01  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>