20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3572 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_3572  PilT protein domain protein  100 
 
 		 125 aa  260  4.999999999999999e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1382  hypothetical protein  60 
 
 		 125 aa  173  7e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000499389  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1443  PilT domain-containing protein  60 
 
 		 125 aa  173  7e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0125509  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0188  PilT protein domain protein  38.4 
 
 		 125 aa  104  5e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3865  PilT domain-containing protein  34.4 
 
 		 126 aa  90.5  7e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.870941  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0599  PilT domain-containing protein  35.29 
 
 		 128 aa  64.3  0.0000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2343  PilT domain-containing protein  30.83 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.487913  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1321  PIN domain protein  29.13 
 
 		 130 aa  56.2  0.0000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.282385  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1380  PilT domain-containing protein  29.13 
 
 		 128 aa  56.2  0.0000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.978498  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1086  PilT domain-containing protein  35.63 
 
 		 90 aa  54.3  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.174841  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2082  PilT protein domain protein  28.57 
 
 		 121 aa  53.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.951724  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5766  PilT protein domain protein  31.97 
 
 		 126 aa  52.4  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.300152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2498  PilT protein domain protein  33.33 
 
 		 136 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0159803 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0051  PilT domain-containing protein  34.48 
 
 		 126 aa  43.9  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.330837 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2559  hypothetical protein  32.84 
 
 		 76 aa  42.7  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00885096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11426  hypothetical protein  30.23 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.3127099999999998e-21  normal  0.106237 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3431  PilT domain-containing protein  30.36 
 
 		 121 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4092  PilT domain-containing protein  30.36 
 
 		 121 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4274  PilT protein-like  30.36 
 
 		 121 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1663  PilT protein-like  27.05 
 
 		 120 aa  41.6  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0881523  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>