39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0188 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0188  PilT protein domain protein  100 
 
 		 125 aa  258  1e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3865  PilT domain-containing protein  74.4 
 
 		 126 aa  201  3e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.870941  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3572  PilT protein domain protein  38.4 
 
 		 125 aa  104  5e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1086  PilT domain-containing protein  50.56 
 
 		 90 aa  95.5  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.174841  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1443  PilT domain-containing protein  36 
 
 		 125 aa  90.1  8e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0125509  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1382  hypothetical protein  36 
 
 		 125 aa  90.1  8e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000499389  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0599  PilT domain-containing protein  35.29 
 
 		 128 aa  70.9  0.000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5766  PilT protein domain protein  31.15 
 
 		 126 aa  68.9  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.300152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0182  prevent-host-death family protein  81.08 
 
 		 116 aa  66.6  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0439238  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1380  PilT domain-containing protein  31.45 
 
 		 128 aa  65.1  0.0000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.978498  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1321  PIN domain protein  31.45 
 
 		 130 aa  64.7  0.0000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.282385  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2343  PilT domain-containing protein  29.06 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.487913  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2498  PilT protein domain protein  30.89 
 
 		 136 aa  54.3  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0159803 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4420  PilT protein domain protein  30.77 
 
 		 128 aa  49.7  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1400  PilT protein domain protein  30.19 
 
 		 140 aa  48.1  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.310156 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6219  PilT protein domain protein  30.08 
 
 		 129 aa  48.1  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.314877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0857  PilT protein  32.67 
 
 		 140 aa  47  0.00009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.159356 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3135  PilT domain-containing protein  30.77 
 
 		 129 aa  46.2  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11426  hypothetical protein  29.77 
 
 		 133 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.3127099999999998e-21  normal  0.106237 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1602  PilT protein-like  30 
 
 		 135 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3346  PilT protein-like  30.36 
 
 		 146 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.732175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3079  PilT protein-like  25.36 
 
 		 146 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.046913  normal  0.55485 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2659  nucleic acid binding protein  26.36 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.234415  normal  0.629356 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1389  nucleic acid binding protein  29.06 
 
 		 125 aa  43.5  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0940077  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4565  PilT protein domain protein  29.29 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1999  PIN domain protein  28.33 
 
 		 150 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0463072  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0505  PilT protein domain protein  26.27 
 
 		 131 aa  42  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2468  PilT protein domain protein  28.57 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0500169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2082  PilT protein domain protein  29.82 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.951724  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2987  PilT protein domain protein  27.13 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1675  PilT domain-containing protein  27.87 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000215959 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1062  PilT protein-like  28.83 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1390  PilT domain-containing protein  31.73 
 
 		 141 aa  42  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1663  PilT protein-like  29.09 
 
 		 120 aa  41.2  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0881523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4336  PilT protein-like  30.1 
 
 		 141 aa  41.2  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.586249 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4543  PilT protein domain protein  26.4 
 
 		 136 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0051  PilT domain-containing protein  27.43 
 
 		 126 aa  40.8  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.330837 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4014  PilT protein domain protein  26.98 
 
 		 137 aa  40.4  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00102621  hitchhiker  0.000259631 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0420  PilT protein domain protein  27.07 
 
 		 137 aa  40.4  0.009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>