58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_B2659 on replicon NC_007595
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007595  Synpcc7942_B2659  nucleic acid binding protein  100 
 
 		 127 aa  259  8.999999999999999e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.234415  normal  0.629356 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1389  nucleic acid binding protein  38.79 
 
 		 125 aa  84.3  5e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0940077  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6219  PilT protein domain protein  34.15 
 
 		 129 aa  82.4  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.314877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1663  PilT protein-like  35.25 
 
 		 120 aa  75.9  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0881523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1062  PilT protein-like  46.9 
 
 		 121 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0656  nucleic acid binding protein  36.97 
 
 		 126 aa  73.9  0.0000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.388004  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1114  nucleic acid binding protein  43.48 
 
 		 100 aa  73.2  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3431  PilT domain-containing protein  40.52 
 
 		 121 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4092  PilT domain-containing protein  40.52 
 
 		 121 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4274  PilT protein-like  40.52 
 
 		 121 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2082  PilT protein domain protein  38.6 
 
 		 121 aa  68.9  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.951724  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1142  nucleic acid-binding protein  41.96 
 
 		 121 aa  68.2  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5766  PilT protein domain protein  34.92 
 
 		 126 aa  63.2  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.300152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2498  PilT protein domain protein  35.61 
 
 		 136 aa  60.1  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0159803 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0679  PilT protein-like  33.08 
 
 		 158 aa  60.1  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000163156  unclonable  0.00000001 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0051  PilT domain-containing protein  36.29 
 
 		 126 aa  58.9  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.330837 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3131  PilT protein domain protein  34.51 
 
 		 124 aa  57  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4014  PilT protein domain protein  34.07 
 
 		 137 aa  52.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00102621  hitchhiker  0.000259631 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1367  PilT protein-like protein  40.35 
 
 		 126 aa  51.6  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.381279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1048  PilT protein domain protein  56.25 
 
 		 109 aa  52  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.71366  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4124  PilT domain-containing protein  31.54 
 
 		 128 aa  50.4  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.113441  normal  0.460306 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2534  PilT protein, N-terminal  44.83 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.641844  normal  0.62652 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0286  PilT protein domain protein  32.03 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.024358  decreased coverage  0.0024847 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0681  hypothetical protein  33.93 
 
 		 127 aa  48.5  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000394475  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1201  PilT protein-like  37.27 
 
 		 121 aa  47.4  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0955216  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1777  PilT domain-containing protein  53.19 
 
 		 143 aa  47.8  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.406004  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4565  PilT protein domain protein  42.11 
 
 		 140 aa  47  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3765  PilT protein domain protein  29.91 
 
 		 133 aa  46.2  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1545  plasmid stabilization protein StbB-like  46.67 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00762824 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0983  PilT domain-containing protein  26.72 
 
 		 133 aa  46.2  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5055  PilT domain-containing protein  31.25 
 
 		 133 aa  46.2  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4749  PilT domain-containing protein  56.76 
 
 		 141 aa  45.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1916  PilT protein-like  24.82 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0013  PilT protein-like  46.43 
 
 		 140 aa  45.4  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4028  PilT protein domain protein  46.81 
 
 		 141 aa  45.4  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1554  PilT protein domain protein  43.55 
 
 		 125 aa  45.1  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.19075  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2839  nucleic acid-binding protein contains PIN domain  42.86 
 
 		 140 aa  44.7  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.454124  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2647  PilT domain-containing protein  34.96 
 
 		 124 aa  44.7  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.434907  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0871  putative plasmid stability-like protein  45.76 
 
 		 137 aa  44.3  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.852163  normal  0.0312935 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4019  PilT protein-like  40 
 
 		 144 aa  44.3  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.506281 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4538  PilT protein domain protein  37.33 
 
 		 140 aa  44.3  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.104439 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1382  hypothetical protein  30.23 
 
 		 125 aa  43.9  0.0007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000499389  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1443  PilT domain-containing protein  30.23 
 
 		 125 aa  43.9  0.0007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0125509  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0188  PilT protein domain protein  26.36 
 
 		 125 aa  43.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0414  PilT protein domain protein  30.83 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1362  plasmid stability protein, putative  40.32 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00298137  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4581  PilT protein-like  39.47 
 
 		 140 aa  42  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.766949  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1999  PIN domain protein  54.29 
 
 		 150 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0463072  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6402  PilT protein domain protein  38.6 
 
 		 141 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2127  vapC protein, putative  29.37 
 
 		 133 aa  41.2  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0057  PilT protein domain protein  37.68 
 
 		 140 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.033229 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2661  PilT domain-containing protein  28.57 
 
 		 124 aa  41.2  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2934  PilT protein-like  32.91 
 
 		 144 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.119744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4619  PilT domain-containing protein  44.68 
 
 		 159 aa  40.8  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3418  PilT protein, N-terminal  51.43 
 
 		 150 aa  40.8  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.317439  normal  0.0554428 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1623  virulence associated protein VagD, putative  30.77 
 
 		 134 aa  40.4  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2155  hypothetical protein  25.74 
 
 		 137 aa  40.4  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0857  PilT protein  36.84 
 
 		 140 aa  40.4  0.009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.159356 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>