69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1675 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1675  PilT domain-containing protein  100 
 
 		 128 aa  254  2e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000215959 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2987  PilT protein domain protein  55 
 
 		 137 aa  144  4.0000000000000006e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0420  PilT protein domain protein  38.33 
 
 		 137 aa  91.7  3e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0414  PilT protein domain protein  36.29 
 
 		 135 aa  85.9  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2539  PilT domain-containing protein  36.51 
 
 		 136 aa  55.5  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.948556 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4731  VagD  36.29 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.761951  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1566  PilT domain-containing protein  36.29 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.123163  normal  0.225999 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0478  virulence-associated protein, putative  32.5 
 
 		 134 aa  52.8  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1545  PilT domain-containing protein  35.48 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.230093  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1627  PilT protein domain protein  34.68 
 
 		 136 aa  52.4  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.733144  normal  0.420461 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0638  PilT protein domain protein  32.5 
 
 		 136 aa  52.8  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4076  plamid maintenance protein  33.88 
 
 		 135 aa  50.4  0.000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1183  PilT protein domain protein  34.48 
 
 		 119 aa  49.7  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4187  DNA replication protein-like protein  32.23 
 
 		 135 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.49294 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0688  PilT domain-containing protein  31.4 
 
 		 132 aa  49.7  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.442109  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6277  PilT protein domain protein  35.94 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.466445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2951  PilT domain-containing protein  30.4 
 
 		 136 aa  49.3  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1063  PilT protein domain protein  30.89 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.471234  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8106  PilT protein domain protein  29.17 
 
 		 138 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2669  PilT protein-like  27.5 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0691561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0908  PilT domain-containing protein  34.15 
 
 		 129 aa  47.8  0.00005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0100677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2719  PilT protein-like  30.4 
 
 		 151 aa  47.4  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.116591 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4794  PilT protein-like  36.29 
 
 		 138 aa  47.4  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0270873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4420  PilT protein domain protein  30 
 
 		 128 aa  47.4  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0728  PilT protein domain protein  27.27 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.741529  hitchhiker  0.0000801582 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1533  PilT protein domain protein  40.32 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0497484  hitchhiker  0.000597174 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0141  plasmid maintenance protein VagD  32.8 
 
 		 138 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6255  PilT domain-containing protein  30.25 
 
 		 135 aa  46.2  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0358672  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1045  virulence-associated protein, putative  28.93 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.491192  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4147  PilT domain-containing protein  33.33 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.448502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0017  PilT domain-containing protein  32 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.461831  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1325  nucleic acid binding protein  29.75 
 
 		 133 aa  46.2  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.000000000000354508  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1213  virulence associated protein C  31.4 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6878  PilT domain-containing protein  29.41 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.425666  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4437  PilT protein-like  28.93 
 
 		 134 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0442  nitrogen regulatory protein NtrR  31.67 
 
 		 134 aa  44.3  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.315733  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2810  PilT protein domain protein  26.05 
 
 		 123 aa  44.3  0.0006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0262171  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3729  PilT protein-like  34.17 
 
 		 133 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.294534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2339  PilT protein domain protein  29.77 
 
 		 141 aa  43.9  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0894  PilT protein, N-terminal  28.93 
 
 		 134 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.282292 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2777  PilT protein domain protein  28.81 
 
 		 134 aa  43.5  0.0009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2472  virulence associated protein C  33.33 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00148493  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3732  nucleic acid-binding protein  31.4 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2505  PilT protein domain protein  29.13 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0188  PilT protein domain protein  27.87 
 
 		 125 aa  42.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0505  putative plasmid stability protein  30.95 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.294814 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0713  PilT domain-containing protein  26.87 
 
 		 141 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000185206  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1340  PilT protein domain protein  27.05 
 
 		 129 aa  42.4  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.382871  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3585  PilT protein domain protein  26.23 
 
 		 129 aa  42.4  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3346  PilT protein-like  33.85 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.732175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2552  PilT domain-containing protein  29.66 
 
 		 152 aa  41.6  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.748536  normal  0.0339823 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2936  PilT domain-containing protein  30.33 
 
 		 130 aa  42  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.203821 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3757  PilT domain-containing protein  28.33 
 
 		 135 aa  41.6  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00272094  normal  0.0228653 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0602  PilT protein domain protein  29.6 
 
 		 135 aa  41.2  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.191075  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3267  plasmid maintenance protein  27.5 
 
 		 132 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1045  PilT domain-containing protein  30.71 
 
 		 139 aa  40.8  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0543043  normal  0.324928 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0234  PilT domain-containing protein  32.63 
 
 		 136 aa  41.2  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.749646 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1777  PilT domain-containing protein  29.84 
 
 		 143 aa  40.8  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.406004  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1067  PilT protein domain protein  32.28 
 
 		 134 aa  40.8  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5055  PilT domain-containing protein  41.51 
 
 		 133 aa  40.8  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0091  PilT protein-like  34.85 
 
 		 144 aa  40.8  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3680  PilT protein domain protein  25.62 
 
 		 134 aa  40.8  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2127  vapC protein, putative  29.63 
 
 		 133 aa  40.8  0.007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4543  PilT protein domain protein  38.54 
 
 		 136 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3368  plasmid maintenance protein  27.5 
 
 		 133 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0505  PilT protein domain protein  23.14 
 
 		 131 aa  40.4  0.009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2343  PilT domain-containing protein  26.98 
 
 		 133 aa  40.4  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.487913  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0440  PilT protein-like  30.33 
 
 		 134 aa  40.4  0.009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000179252  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1681  PilT protein-like  29.51 
 
 		 136 aa  40.4  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.116331  normal  0.664267 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>