55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0908 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0908  PilT domain-containing protein  100 
 
 		 129 aa  260  4.999999999999999e-69  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0100677  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2810  PilT protein domain protein  56.2 
 
 		 123 aa  145  2.0000000000000003e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0262171  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2987  PilT protein domain protein  31.06 
 
 		 137 aa  53.9  0.0000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0420  PilT protein domain protein  38.57 
 
 		 137 aa  53.5  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0983  PilT domain-containing protein  32.35 
 
 		 133 aa  50.1  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4019  PilT protein-like  34.95 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.506281 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1533  PilT protein domain protein  29.13 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0497484  hitchhiker  0.000597174 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1183  PilT protein domain protein  28.28 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3988  PilT protein domain protein  31.67 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0532731 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1138  PilT domain-containing protein  36.76 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3939  PilT protein domain protein  31.97 
 
 		 133 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1675  PilT domain-containing protein  34.15 
 
 		 128 aa  47.8  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000215959 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1771  hypothetical protein  36.92 
 
 		 133 aa  47.8  0.00006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0074  PilT protein domain protein  33 
 
 		 139 aa  47.4  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0701  PilT protein domain protein  38.1 
 
 		 136 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.528227 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4187  DNA replication protein-like protein  32.28 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.49294 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0442  nitrogen regulatory protein NtrR  40.62 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.315733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4076  plamid maintenance protein  32.28 
 
 		 135 aa  45.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0898  PilT protein domain protein  38.57 
 
 		 131 aa  45.8  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.185586  normal  0.0272728 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2468  PilT protein domain protein  45.1 
 
 		 135 aa  45.4  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0500169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4014  PilT protein domain protein  48.89 
 
 		 137 aa  45.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00102621  hitchhiker  0.000259631 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3575  PilT protein domain protein  30.53 
 
 		 140 aa  45.1  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00704853  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4538  PilT protein domain protein  26.12 
 
 		 140 aa  45.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.104439 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2127  vapC protein, putative  30.63 
 
 		 133 aa  44.3  0.0005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3304  PilT protein domain protein  32.53 
 
 		 126 aa  44.7  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3905  PilT domain-containing protein  28.57 
 
 		 134 aa  44.7  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.646522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4147  PilT domain-containing protein  41.79 
 
 		 134 aa  44.3  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.448502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0478  virulence-associated protein, putative  36.36 
 
 		 134 aa  43.9  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0057  PilT protein domain protein  41.18 
 
 		 140 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.033229 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0638  PilT protein domain protein  36.36 
 
 		 136 aa  43.9  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3269  PilT protein-like  38.1 
 
 		 133 aa  43.9  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159462  hitchhiker  0.00995267 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1868  PilT domain-containing protein  29.63 
 
 		 133 aa  43.5  0.0009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000212984  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0286  PilT protein domain protein  35.38 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.024358  decreased coverage  0.0024847 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2669  PilT protein-like  34.78 
 
 		 132 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0691561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1964  PilT protein domain protein  32.65 
 
 		 141 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.313407 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0505  PilT protein domain protein  37.5 
 
 		 131 aa  42.4  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1823  PilT domain-containing protein  28.28 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.402154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3368  plasmid maintenance protein  36.07 
 
 		 133 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3267  plasmid maintenance protein  36.07 
 
 		 132 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0234  PilT domain-containing protein  31.25 
 
 		 136 aa  42  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.749646 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6178  PilT protein, N-terminal  30.26 
 
 		 133 aa  41.6  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.382745  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1777  PilT domain-containing protein  30 
 
 		 143 aa  41.6  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.406004  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1876  plasmid stabilization protein StbB-like  29.37 
 
 		 139 aa  41.6  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.417395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0688  PilT domain-containing protein  35.14 
 
 		 132 aa  41.6  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.442109  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3757  PilT domain-containing protein  33.87 
 
 		 135 aa  41.6  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00272094  normal  0.0228653 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1362  plasmid stability protein, putative  32.65 
 
 		 142 aa  41.2  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00298137  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0156  PilT protein domain protein  38.1 
 
 		 134 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1484  hypothetical protein  29.03 
 
 		 141 aa  40.8  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.174904  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4575  PilT protein-like  29.41 
 
 		 137 aa  40.8  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4731  VagD  39.29 
 
 		 138 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.761951  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4624  PilT domain-containing protein  38.71 
 
 		 136 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.723585  normal  0.112001 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3461  PilT domain-containing protein  26.23 
 
 		 135 aa  40.4  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.999718 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0414  PilT protein domain protein  36 
 
 		 135 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5170  PilT protein domain protein  32.76 
 
 		 147 aa  40  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3968  PilT domain-containing protein  26.98 
 
 		 135 aa  40  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.10464  normal  0.34904 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>