35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3304 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_3304  PilT protein domain protein  100 
 
 
126 aa  254  3e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0267  PilT protein domain protein  48.03 
 
 
127 aa  115  3e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0148282 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4829  PilT protein domain protein  40.8 
 
 
130 aa  85.1  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4050  PilT protein domain protein  33.61 
 
 
131 aa  53.9  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1110  PilT protein domain protein  32.2 
 
 
138 aa  53.1  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.871777  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4204  PilT protein domain protein  31.36 
 
 
133 aa  52.4  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1337  PilT protein domain protein  31.71 
 
 
129 aa  52.4  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.1325  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0152  PilT protein domain protein  36.8 
 
 
134 aa  51.6  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0160  PilT protein domain protein  31.9 
 
 
131 aa  51.2  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.221869  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1340  PilT protein domain protein  29.77 
 
 
129 aa  48.1  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.382871  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1138  PilT domain-containing protein  44.26 
 
 
133 aa  48.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23550  predicted nucleic acid-binding protein, contains PIN domain protein  44.26 
 
 
142 aa  47.4  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.46968  normal  0.640927 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0397  PilT protein-like  29.25 
 
 
123 aa  47  0.00008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1904  PilT protein domain protein  28.69 
 
 
129 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.101114 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4437  PilT protein-like  34.38 
 
 
134 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3267  plasmid maintenance protein  35.8 
 
 
132 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6178  PilT protein, N-terminal  35.14 
 
 
133 aa  44.7  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.382745  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4624  PilT domain-containing protein  30.77 
 
 
136 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.723585  normal  0.112001 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4076  plamid maintenance protein  38.27 
 
 
135 aa  45.1  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0908  PilT domain-containing protein  32.53 
 
 
129 aa  44.7  0.0005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0100677  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4187  DNA replication protein-like protein  37.04 
 
 
135 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.49294 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1771  hypothetical protein  41.67 
 
 
133 aa  44.3  0.0006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3968  PilT domain-containing protein  30.89 
 
 
135 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.10464  normal  0.34904 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3697  PilT protein domain protein  40.26 
 
 
138 aa  43.5  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1936  PilT protein domain protein  31.15 
 
 
137 aa  43.1  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1848  PilT protein domain protein  31.75 
 
 
129 aa  43.5  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1183  PilT protein domain protein  41.94 
 
 
119 aa  43.5  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3680  PilT protein domain protein  42.62 
 
 
134 aa  42.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1788  PilT protein domain protein  29.36 
 
 
136 aa  41.6  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.813085  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2129  virulence-associated protein, putative  29.36 
 
 
136 aa  41.6  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0156283  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0688  PilT domain-containing protein  28.46 
 
 
132 aa  41.6  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.442109  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3368  plasmid maintenance protein  34.57 
 
 
133 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.911  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0440  PilT protein-like  43.1 
 
 
134 aa  41.6  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000179252  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3461  PilT domain-containing protein  30.08 
 
 
135 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.999718 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0983  PilT domain-containing protein  30.47 
 
 
133 aa  40  0.01  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>