40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0397 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_0397  PilT protein-like  100 
 
 		 123 aa  244  4e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1702  PilT domain-containing protein  43.09 
 
 		 130 aa  110  7.000000000000001e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0985  PilT domain-containing protein  44.44 
 
 		 129 aa  103  1e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.483809  normal  0.193625 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5055  PilT domain-containing protein  29.46 
 
 		 133 aa  62  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1769  hypothetical protein  31.62 
 
 		 131 aa  57  0.00000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1337  PilT protein domain protein  28.04 
 
 		 129 aa  57  0.00000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.1325  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0688  PilT domain-containing protein  32.2 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.442109  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1183  PilT protein domain protein  28.72 
 
 		 119 aa  54.3  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1848  PilT protein domain protein  26.6 
 
 		 129 aa  51.2  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2557  PilT protein domain protein  27.97 
 
 		 135 aa  50.8  0.000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.308124  normal  0.19537 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3585  PilT protein domain protein  32.43 
 
 		 129 aa  50.8  0.000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2472  virulence associated protein C  27.27 
 
 		 133 aa  49.7  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00148493  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2129  virulence-associated protein, putative  29.41 
 
 		 136 aa  49.7  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0156283  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1788  PilT protein domain protein  29.41 
 
 		 136 aa  49.7  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.813085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1138  PilT domain-containing protein  29.29 
 
 		 133 aa  50.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2936  PilT domain-containing protein  34.07 
 
 		 130 aa  48.9  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.203821 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3269  PilT protein-like  32.32 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159462  hitchhiker  0.00995267 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4829  PilT protein domain protein  28.43 
 
 		 130 aa  48.5  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4624  PilT domain-containing protein  28.85 
 
 		 136 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.723585  normal  0.112001 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1340  PilT protein domain protein  29.63 
 
 		 129 aa  47.4  0.00006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.382871  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0602  PilT protein domain protein  25.2 
 
 		 135 aa  47.4  0.00007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.191075  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3304  PilT protein domain protein  29.25 
 
 		 126 aa  47  0.00008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1868  PilT domain-containing protein  28.57 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000212984  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0505  PilT protein domain protein  23.97 
 
 		 131 aa  46.2  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1904  PilT protein domain protein  28.43 
 
 		 129 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.101114 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6878  PilT domain-containing protein  27.73 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.425666  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6255  PilT domain-containing protein  27.12 
 
 		 135 aa  45.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0358672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0267  PilT protein domain protein  25.74 
 
 		 127 aa  45.4  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0148282 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3939  PilT protein domain protein  31.91 
 
 		 133 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3697  PilT protein domain protein  24.56 
 
 		 138 aa  44.3  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12568  hypothetical protein  27.43 
 
 		 125 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.724019  normal  0.141761 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3558  PilT domain-containing protein  30.88 
 
 		 128 aa  43.9  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2777  PilT protein domain protein  29.03 
 
 		 134 aa  43.9  0.0008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1045  virulence-associated protein, putative  27.12 
 
 		 134 aa  42.7  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.491192  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1812  PilT domain-containing protein  25.86 
 
 		 132 aa  42.7  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.034692  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1319  PilT protein domain protein  27.18 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1325  nucleic acid binding protein  28.81 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.000000000000354508  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0898  PilT protein domain protein  25.69 
 
 		 131 aa  41.6  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.185586  normal  0.0272728 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2951  PilT domain-containing protein  27.42 
 
 		 136 aa  40.8  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2552  PilT domain-containing protein  32.31 
 
 		 152 aa  40.8  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.748536  normal  0.0339823 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>