69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4829 on replicon NC_013746
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013746  Htur_4829  PilT protein domain protein  100 
 
 
130 aa  267  4e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3304  PilT protein domain protein  40.8 
 
 
126 aa  85.1  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0267  PilT protein domain protein  40 
 
 
127 aa  83.2  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0148282 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1533  PilT protein domain protein  38.52 
 
 
132 aa  79.3  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0497484  hitchhiker  0.000597174 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0152  PilT protein domain protein  32.54 
 
 
134 aa  66.2  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4050  PilT protein domain protein  32.48 
 
 
131 aa  63.9  0.0000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4437  PilT protein-like  39.53 
 
 
134 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1936  PilT protein domain protein  32.76 
 
 
137 aa  61.6  0.000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3461  PilT domain-containing protein  37.1 
 
 
135 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.999718 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3968  PilT domain-containing protein  37.6 
 
 
135 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.10464  normal  0.34904 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1110  PilT protein domain protein  33.61 
 
 
138 aa  59.3  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.871777  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0602  PilT protein domain protein  34.26 
 
 
135 aa  57.8  0.00000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.191075  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6178  PilT protein, N-terminal  33.08 
 
 
133 aa  57  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.382745  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1183  PilT protein domain protein  34.21 
 
 
119 aa  56.2  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1337  PilT protein domain protein  30.58 
 
 
129 aa  56.2  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.1325  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4600  putative nitrogen regulatory protein (NtrR-like), putative virulence associated protein (vap)  39.1 
 
 
135 aa  56.2  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.660475  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2129  virulence-associated protein, putative  36 
 
 
136 aa  56.2  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0156283  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1788  PilT protein domain protein  36 
 
 
136 aa  56.2  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.813085  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4204  PilT protein domain protein  32.77 
 
 
133 aa  55.5  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1433  PilT protein domain protein  29.84 
 
 
130 aa  55.1  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.697875  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2951  PilT domain-containing protein  34.69 
 
 
136 aa  55.1  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0688  PilT domain-containing protein  31.63 
 
 
132 aa  55.1  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.442109  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1848  PilT protein domain protein  33.61 
 
 
129 aa  54.7  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1904  PilT protein domain protein  32.23 
 
 
129 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.101114 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3267  plasmid maintenance protein  31.31 
 
 
132 aa  53.9  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4624  PilT domain-containing protein  30.08 
 
 
136 aa  53.5  0.0000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.723585  normal  0.112001 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1138  PilT domain-containing protein  36.84 
 
 
133 aa  53.5  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1771  hypothetical protein  31.91 
 
 
133 aa  53.5  0.0000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0286  PilT protein domain protein  30.65 
 
 
135 aa  53.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.024358  decreased coverage  0.0024847 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0160  PilT protein domain protein  31.09 
 
 
131 aa  52.8  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.221869  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3680  PilT protein domain protein  34.34 
 
 
134 aa  52.4  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5055  PilT domain-containing protein  31.97 
 
 
133 aa  52.4  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1045  virulence-associated protein, putative  37.23 
 
 
134 aa  52  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.491192  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4187  DNA replication protein-like protein  33.33 
 
 
135 aa  51.6  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.49294 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3368  plasmid maintenance protein  30.3 
 
 
133 aa  50.8  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.911  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0894  PilT protein, N-terminal  37.23 
 
 
134 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.282292 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1868  PilT domain-containing protein  31.73 
 
 
133 aa  50.8  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000212984  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2777  PilT protein domain protein  30.61 
 
 
134 aa  50.4  0.000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2472  virulence associated protein C  29.84 
 
 
133 aa  49.3  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00148493  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4076  plamid maintenance protein  31.67 
 
 
135 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0397  PilT protein-like  28.43 
 
 
123 aa  48.5  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5766  PilT protein domain protein  28.91 
 
 
126 aa  47.8  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.300152  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1461  PilT protein domain protein  34.34 
 
 
134 aa  47.4  0.00006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2552  PilT domain-containing protein  31.58 
 
 
152 aa  47.4  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.748536  normal  0.0339823 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3269  PilT protein-like  31.97 
 
 
133 aa  47  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159462  hitchhiker  0.00995267 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2669  PilT protein-like  26.85 
 
 
132 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0691561  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0728  PilT protein domain protein  30.36 
 
 
132 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.741529  hitchhiker  0.0000801582 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3988  PilT protein domain protein  32.79 
 
 
133 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0532731 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4420  PilT protein domain protein  28 
 
 
128 aa  45.4  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1484  hypothetical protein  34.33 
 
 
141 aa  44.7  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.174904  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3939  PilT protein domain protein  33.61 
 
 
133 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1433  NtrR protein  30.3 
 
 
140 aa  44.7  0.0005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1340  PilT protein domain protein  33.61 
 
 
129 aa  44.3  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.382871  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1401  PilT protein domain protein  27.13 
 
 
126 aa  44.3  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000484523 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2557  PilT protein domain protein  26.92 
 
 
135 aa  43.9  0.0007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.308124  normal  0.19537 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0478  virulence-associated protein, putative  28.3 
 
 
134 aa  43.5  0.0009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0638  PilT protein domain protein  28.3 
 
 
136 aa  43.5  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0091  PilT domain-containing protein  27.78 
 
 
132 aa  43.5  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1213  virulence associated protein C  27.56 
 
 
138 aa  43.1  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0985  PilT domain-containing protein  30.65 
 
 
129 aa  43.5  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.483809  normal  0.193625 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1067  PilT protein domain protein  29.92 
 
 
134 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1681  PilT protein-like  32.31 
 
 
136 aa  42  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.116331  normal  0.664267 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1627  PilT protein domain protein  33.33 
 
 
136 aa  42  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.733144  normal  0.420461 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2468  PilT protein domain protein  28.91 
 
 
135 aa  41.2  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0500169  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3905  PilT domain-containing protein  30.21 
 
 
134 aa  40.8  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.646522  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0440  PilT protein-like  26.92 
 
 
134 aa  40.8  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000179252  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0701  PilT protein domain protein  28.46 
 
 
136 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.528227 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1778  hypothetical protein  30.3 
 
 
121 aa  40.4  0.008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0747153  normal  0.287318 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2719  PilT protein-like  29.2 
 
 
151 aa  40.4  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.116591 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>