95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1340 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_1340  PilT protein domain protein  100 
 
 		 129 aa  257  4e-68  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.382871  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3585  PilT protein domain protein  74.42 
 
 		 129 aa  199  9.999999999999999e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0058  PilT protein domain protein  79.66 
 
 		 118 aa  190  5e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0223117  normal  0.362621 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2557  PilT protein domain protein  41.48 
 
 		 135 aa  97.8  4e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.308124  normal  0.19537 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1433  PilT protein domain protein  38.46 
 
 		 130 aa  90.1  1e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.697875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1183  PilT protein domain protein  41.84 
 
 		 119 aa  72  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0152  PilT protein domain protein  32.56 
 
 		 134 aa  67  0.00000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0602  PilT protein domain protein  32.31 
 
 		 135 aa  65.9  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.191075  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3757  PilT domain-containing protein  38 
 
 		 135 aa  65.9  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00272094  normal  0.0228653 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0985  PilT domain-containing protein  32.77 
 
 		 129 aa  63.5  0.0000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.483809  normal  0.193625 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0728  PilT protein domain protein  32.56 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.741529  hitchhiker  0.0000801582 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3680  PilT protein domain protein  33.33 
 
 		 134 aa  60.5  0.000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0894  PilT protein, N-terminal  30.23 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.282292 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1138  PilT domain-containing protein  30.77 
 
 		 133 aa  58.2  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0091  PilT domain-containing protein  30.23 
 
 		 132 aa  56.2  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1461  PilT protein domain protein  31.82 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1533  PilT protein domain protein  27.5 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0497484  hitchhiker  0.000597174 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1045  virulence-associated protein, putative  28.68 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.491192  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2472  virulence associated protein C  29.51 
 
 		 133 aa  55.1  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00148493  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2936  PilT domain-containing protein  29.75 
 
 		 130 aa  54.7  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.203821 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1681  PilT protein-like  33.83 
 
 		 136 aa  53.5  0.0000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.116331  normal  0.664267 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1063  PilT protein domain protein  27.69 
 
 		 139 aa  53.5  0.0000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.471234  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0688  PilT domain-containing protein  26.45 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.442109  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0505  PilT protein domain protein  26.45 
 
 		 131 aa  53.1  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4624  PilT domain-containing protein  28.68 
 
 		 136 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.723585  normal  0.112001 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3267  plasmid maintenance protein  34.02 
 
 		 132 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4187  DNA replication protein-like protein  28.68 
 
 		 135 aa  51.6  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.49294 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1702  PilT domain-containing protein  28.91 
 
 		 130 aa  51.2  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3368  plasmid maintenance protein  34.02 
 
 		 133 aa  51.2  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2084  PilT protein-like protein  39 
 
 		 135 aa  50.8  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.236876  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1484  hypothetical protein  30.77 
 
 		 141 aa  50.8  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.174904  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4076  plamid maintenance protein  28.68 
 
 		 135 aa  50.4  0.000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2987  PilT protein domain protein  27.13 
 
 		 137 aa  49.7  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1868  PilT domain-containing protein  27.87 
 
 		 133 aa  50.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000212984  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3905  PilT domain-containing protein  28.68 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.646522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1848  PilT protein domain protein  28 
 
 		 129 aa  50.1  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3729  PilT protein-like  28.46 
 
 		 133 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.294534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1067  PilT protein domain protein  30.89 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2669  PilT protein-like  29.23 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0691561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6178  PilT protein, N-terminal  28.69 
 
 		 133 aa  48.9  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.382745  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2468  PilT protein domain protein  29.37 
 
 		 135 aa  48.9  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0500169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0701  PilT protein domain protein  29.6 
 
 		 136 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.528227 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0091  PilT protein-like  30.83 
 
 		 144 aa  48.9  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36180  PilT domain-containing protein  31.3 
 
 		 136 aa  48.1  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1876  PilT protein domain protein  29.77 
 
 		 129 aa  48.5  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3304  PilT protein domain protein  29.77 
 
 		 126 aa  48.1  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0440  PilT protein-like  28.46 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000179252  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5884  PilT domain-containing protein  34.78 
 
 		 148 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.669409 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1337  PilT protein domain protein  25.96 
 
 		 129 aa  48.1  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.1325  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4600  putative nitrogen regulatory protein (NtrR-like), putative virulence associated protein (vap)  32.26 
 
 		 135 aa  47.8  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.660475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0442  nitrogen regulatory protein NtrR  28.68 
 
 		 134 aa  47.8  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.315733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0397  PilT protein-like  29.63 
 
 		 123 aa  47.4  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0638  PilT protein domain protein  25.58 
 
 		 136 aa  47.4  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0267  PilT protein domain protein  33.85 
 
 		 127 aa  47.8  0.00006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0148282 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0478  virulence-associated protein, putative  25.58 
 
 		 134 aa  47.8  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2719  PilT protein-like  30.37 
 
 		 151 aa  47  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.116591 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1213  virulence associated protein C  26.77 
 
 		 138 aa  47  0.00009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4420  PilT protein domain protein  30.34 
 
 		 128 aa  46.6  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3346  PilT protein-like  36.27 
 
 		 146 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.732175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2129  virulence-associated protein, putative  27.27 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0156283  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3732  nucleic acid-binding protein  30 
 
 		 132 aa  45.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4147  PilT domain-containing protein  26.92 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.448502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0156  PilT protein domain protein  34.44 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1788  PilT protein domain protein  27.27 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.813085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1627  PilT protein domain protein  28.79 
 
 		 136 aa  46.2  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.733144  normal  0.420461 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1319  PilT protein domain protein  31.11 
 
 		 140 aa  45.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2552  PilT domain-containing protein  27.08 
 
 		 152 aa  45.1  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.748536  normal  0.0339823 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3461  PilT domain-containing protein  26.23 
 
 		 135 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.999718 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4437  PilT protein-like  29.27 
 
 		 134 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0483  PilT domain-containing protein  28.46 
 
 		 133 aa  44.7  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4829  PilT protein domain protein  33.61 
 
 		 130 aa  44.3  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3968  PilT domain-containing protein  26.23 
 
 		 135 aa  44.7  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.10464  normal  0.34904 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1771  hypothetical protein  25.84 
 
 		 133 aa  44.3  0.0006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2951  PilT domain-containing protein  26.36 
 
 		 136 aa  42.7  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6878  PilT domain-containing protein  29.46 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.425666  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1823  PilT domain-containing protein  26.72 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.402154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0286  PilT protein domain protein  25.38 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.024358  decreased coverage  0.0024847 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0679  PilT protein-like  28.69 
 
 		 158 aa  43.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000163156  unclonable  0.00000001 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3079  PilT protein-like  33.33 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.046913  normal  0.55485 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0576  PilT protein-like  37.35 
 
 		 121 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.198273  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0414  PilT protein domain protein  23.14 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6255  PilT domain-containing protein  27.91 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0358672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1675  PilT domain-containing protein  27.05 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000215959 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1325  nucleic acid binding protein  23.26 
 
 		 133 aa  42  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.000000000000354508  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4543  PilT protein domain protein  37.62 
 
 		 136 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1045  PilT domain-containing protein  28.78 
 
 		 139 aa  41.6  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0543043  normal  0.324928 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2777  PilT protein domain protein  24.81 
 
 		 134 aa  41.6  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1904  PilT protein domain protein  27.36 
 
 		 129 aa  41.6  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.101114 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1380  PilT domain-containing protein  32 
 
 		 128 aa  41.6  0.004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.978498  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1321  PIN domain protein  32 
 
 		 130 aa  41.6  0.004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.282385  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0898  PilT protein domain protein  24.81 
 
 		 131 aa  41.6  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.185586  normal  0.0272728 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9108  pilT protein, N-terminal  33.58 
 
 		 143 aa  40.8  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2391  PIN (PilT N terminus) domain  27.66 
 
 		 95 aa  40.4  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8106  PilT protein domain protein  24.41 
 
 		 138 aa  40.4  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0630  PilT protein domain protein  28.36 
 
 		 137 aa  40  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.317071 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>