128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2987 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2987  PilT protein domain protein  100 
 
 		 137 aa  276  6e-74  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1675  PilT domain-containing protein  55 
 
 		 128 aa  144  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000215959 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0420  PilT protein domain protein  43.85 
 
 		 137 aa  110  5e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0414  PilT protein domain protein  30.77 
 
 		 135 aa  74.3  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4187  DNA replication protein-like protein  34.81 
 
 		 135 aa  63.9  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.49294 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1183  PilT protein domain protein  33.62 
 
 		 119 aa  63.2  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4076  plamid maintenance protein  34.81 
 
 		 135 aa  62  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0602  PilT protein domain protein  31.11 
 
 		 135 aa  61.2  0.000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.191075  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1777  PilT domain-containing protein  34.04 
 
 		 143 aa  60.5  0.000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.406004  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3680  PilT protein domain protein  30.08 
 
 		 134 aa  60.1  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6255  PilT domain-containing protein  32.56 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0358672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0728  PilT protein domain protein  34.62 
 
 		 132 aa  58.2  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.741529  hitchhiker  0.0000801582 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2669  PilT protein-like  27.69 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0691561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6878  PilT domain-containing protein  31.06 
 
 		 136 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.425666  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1319  PilT protein domain protein  31.69 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2777  PilT protein domain protein  32.61 
 
 		 134 aa  57  0.00000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1627  PilT protein domain protein  30.6 
 
 		 136 aa  57.4  0.00000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.733144  normal  0.420461 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0155  PilT protein domain protein  32.85 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.538447 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0478  virulence-associated protein, putative  31.34 
 
 		 134 aa  57  0.00000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1461  PilT protein domain protein  28.57 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2719  PilT protein-like  30.77 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.116591 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2936  PilT domain-containing protein  35.66 
 
 		 130 aa  56.6  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.203821 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0638  PilT protein domain protein  31.34 
 
 		 136 aa  56.6  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1325  nucleic acid binding protein  32.82 
 
 		 133 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.000000000000354508  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6277  PilT protein domain protein  32.39 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.466445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2539  PilT domain-containing protein  35.29 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.948556 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3939  PilT protein domain protein  33.08 
 
 		 133 aa  55.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2127  vapC protein, putative  30 
 
 		 133 aa  55.1  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0701  PilT protein domain protein  28.68 
 
 		 136 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.528227 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3585  PilT protein domain protein  30.23 
 
 		 129 aa  54.7  0.0000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4420  PilT protein domain protein  37.5 
 
 		 128 aa  55.1  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4731  VagD  30.66 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.761951  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3732  nucleic acid-binding protein  32.31 
 
 		 132 aa  54.7  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3461  PilT domain-containing protein  32.85 
 
 		 135 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.999718 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4147  PilT domain-containing protein  32.56 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.448502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1533  PilT protein domain protein  34.41 
 
 		 132 aa  54.7  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0497484  hitchhiker  0.000597174 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3968  PilT domain-containing protein  32.85 
 
 		 135 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.10464  normal  0.34904 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6178  PilT protein, N-terminal  30.53 
 
 		 133 aa  53.5  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.382745  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0908  PilT domain-containing protein  31.06 
 
 		 129 aa  53.9  0.0000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0100677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3757  PilT domain-containing protein  31.54 
 
 		 135 aa  53.9  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00272094  normal  0.0228653 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1484  hypothetical protein  28.47 
 
 		 141 aa  53.1  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.174904  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2810  PilT protein domain protein  30.65 
 
 		 123 aa  52.8  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0262171  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0688  PilT domain-containing protein  31.06 
 
 		 132 aa  52.8  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.442109  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3905  PilT domain-containing protein  30.53 
 
 		 134 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.646522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8106  PilT protein domain protein  30.08 
 
 		 138 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4538  PilT protein domain protein  31.43 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.104439 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1904  PilT protein domain protein  30.77 
 
 		 129 aa  52  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.101114 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0857  PilT protein  31.94 
 
 		 140 aa  51.6  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.159356 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3729  PilT protein-like  31.58 
 
 		 133 aa  51.2  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.294534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1337  PilT protein domain protein  30.6 
 
 		 129 aa  51.6  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.1325  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1045  virulence-associated protein, putative  28.15 
 
 		 134 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.491192  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0442  nitrogen regulatory protein NtrR  32.56 
 
 		 134 aa  50.8  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.315733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0091  PilT domain-containing protein  29.77 
 
 		 132 aa  50.8  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2552  PilT domain-containing protein  33.83 
 
 		 152 aa  50.8  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.748536  normal  0.0339823 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4028  PilT protein domain protein  34.53 
 
 		 141 aa  50.4  0.000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0894  PilT protein, N-terminal  28.89 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.282292 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4014  PilT protein domain protein  43.75 
 
 		 137 aa  49.7  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00102621  hitchhiker  0.000259631 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2597  PilT protein-like protein  33.08 
 
 		 133 aa  50.1  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2826  PilT protein-like  32.35 
 
 		 135 aa  50.1  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.640016  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5055  PilT domain-containing protein  32.98 
 
 		 133 aa  49.7  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1340  PilT protein domain protein  27.13 
 
 		 129 aa  49.7  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.382871  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0505  PilT protein domain protein  25 
 
 		 131 aa  49.7  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3267  plasmid maintenance protein  31.96 
 
 		 132 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3368  plasmid maintenance protein  31.96 
 
 		 133 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0058  PilT protein domain protein  29.51 
 
 		 118 aa  49.3  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0223117  normal  0.362621 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1067  PilT protein domain protein  28.15 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4624  PilT domain-containing protein  27.27 
 
 		 136 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.723585  normal  0.112001 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0440  PilT protein-like  31.82 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000179252  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0152  PilT protein domain protein  31.3 
 
 		 134 aa  48.9  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1362  plasmid stability protein, putative  32.14 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00298137  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3988  PilT protein domain protein  31.34 
 
 		 133 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0532731 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5262  PilT protein domain protein  28.99 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0679342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1382  hypothetical protein  30.95 
 
 		 125 aa  47.8  0.00005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000499389  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1443  PilT domain-containing protein  30.95 
 
 		 125 aa  47.8  0.00005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0125509  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0483  PilT domain-containing protein  28.46 
 
 		 133 aa  47.4  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2951  PilT domain-containing protein  29.71 
 
 		 136 aa  47.8  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3269  PilT protein-like  36.17 
 
 		 133 aa  47.4  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159462  hitchhiker  0.00995267 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1063  PilT protein domain protein  26.32 
 
 		 139 aa  47.4  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.471234  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1999  PIN domain protein  31.21 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0463072  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3902  PilT domain-containing protein  32.37 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0505  putative plasmid stability protein  29.2 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.294814 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4364  PilT domain-containing protein  32.37 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0286  PilT protein domain protein  26.67 
 
 		 135 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.024358  decreased coverage  0.0024847 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1213  virulence associated protein C  31.78 
 
 		 138 aa  46.2  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4437  PilT protein-like  28.46 
 
 		 134 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3903  PilT protein-like  31.65 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4465  PilT domain-containing protein  31.65 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1138  PilT domain-containing protein  28.7 
 
 		 133 aa  46.2  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5837  PilT domain-containing protein  31.65 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.380144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1566  PilT domain-containing protein  30.6 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.123163  normal  0.225999 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03915  predicted nucleic acid-binding protein,contains PIN domain  28.71 
 
 		 101 aa  45.4  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.968864  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1545  PilT domain-containing protein  29.63 
 
 		 140 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.230093  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2721  PilT protein-like protein  48.15 
 
 		 125 aa  45.1  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.865953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0234  PilT domain-containing protein  31.68 
 
 		 136 aa  45.1  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.749646 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2764  PilT protein domain protein  45.61 
 
 		 60 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0599  PilT domain-containing protein  34.69 
 
 		 128 aa  44.7  0.0005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0138  PilT domain-containing protein  30.43 
 
 		 133 aa  44.7  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0657  PilT protein domain protein  35.56 
 
 		 129 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2620  PilT protein domain protein  33.09 
 
 		 134 aa  44.3  0.0006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2366  PilT protein domain protein  27.91 
 
 		 137 aa  44.3  0.0006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>