20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2810 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_2810  PilT protein domain protein  100 
 
 		 123 aa  249  1e-65  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0262171  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0908  PilT domain-containing protein  56.2 
 
 		 129 aa  145  2.0000000000000003e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0100677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0420  PilT protein domain protein  33.85 
 
 		 137 aa  65.9  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2987  PilT protein domain protein  30.65 
 
 		 137 aa  52.8  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1533  PilT protein domain protein  32.26 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0497484  hitchhiker  0.000597174 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0983  PilT domain-containing protein  32.26 
 
 		 133 aa  48.9  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0505  PilT protein domain protein  38.1 
 
 		 131 aa  45.8  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1702  PilT domain-containing protein  29.85 
 
 		 130 aa  45.1  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1675  PilT domain-containing protein  26.05 
 
 		 128 aa  44.3  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000215959 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0701  PilT protein domain protein  40.74 
 
 		 136 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.528227 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4538  PilT protein domain protein  24.04 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.104439 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3939  PilT protein domain protein  39.62 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4420  PilT protein domain protein  28.57 
 
 		 128 aa  42.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1437  hypothetical protein  44.44 
 
 		 79 aa  42  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000238357  normal  0.0222141 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0414  PilT protein domain protein  33.93 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0074  PilT protein domain protein  40.68 
 
 		 139 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3269  PilT protein-like  37.7 
 
 		 133 aa  40.8  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159462  hitchhiker  0.00995267 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2127  vapC protein, putative  39.29 
 
 		 133 aa  40.8  0.007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1159  PilT protein domain protein  28.81 
 
 		 132 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.876268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6878  PilT domain-containing protein  28.57 
 
 		 136 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.425666  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>