121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0420 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0420  PilT protein domain protein  100 
 
 		 137 aa  275  2e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2987  PilT protein domain protein  43.85 
 
 		 137 aa  110  5e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0414  PilT protein domain protein  39.39 
 
 		 135 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1675  PilT domain-containing protein  38.33 
 
 		 128 aa  91.7  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000215959 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3757  PilT domain-containing protein  33.82 
 
 		 135 aa  74.3  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00272094  normal  0.0228653 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2719  PilT protein-like  32.12 
 
 		 151 aa  73.6  0.0000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.116591 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4624  PilT domain-containing protein  34.59 
 
 		 136 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.723585  normal  0.112001 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2810  PilT protein domain protein  33.85 
 
 		 123 aa  65.9  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0262171  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0688  PilT domain-containing protein  33.83 
 
 		 132 aa  65.1  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.442109  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2127  vapC protein, putative  32.28 
 
 		 133 aa  63.9  0.0000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5055  PilT domain-containing protein  25.58 
 
 		 133 aa  63.9  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3988  PilT protein domain protein  35.56 
 
 		 133 aa  63.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0532731 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4187  DNA replication protein-like protein  30.6 
 
 		 135 aa  63.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.49294 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3680  PilT protein domain protein  32.84 
 
 		 134 aa  63.2  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1045  virulence-associated protein, putative  30.88 
 
 		 134 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.491192  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1533  PilT protein domain protein  33.33 
 
 		 132 aa  62.4  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0497484  hitchhiker  0.000597174 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0234  PilT domain-containing protein  35 
 
 		 136 aa  62.4  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.749646 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2951  PilT domain-containing protein  35.82 
 
 		 136 aa  62.4  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1484  hypothetical protein  33.59 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.174904  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3732  nucleic acid-binding protein  32.03 
 
 		 132 aa  62  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0440  PilT protein-like  32.35 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000179252  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1325  nucleic acid binding protein  34.11 
 
 		 133 aa  61.6  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.000000000000354508  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3269  PilT protein-like  29.55 
 
 		 133 aa  61.2  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159462  hitchhiker  0.00995267 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3939  PilT protein domain protein  34.81 
 
 		 133 aa  61.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4076  plamid maintenance protein  30.6 
 
 		 135 aa  61.2  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0894  PilT protein, N-terminal  30.88 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.282292 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1063  PilT protein domain protein  30.3 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.471234  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1788  PilT protein domain protein  29.85 
 
 		 136 aa  59.7  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.813085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2129  virulence-associated protein, putative  29.85 
 
 		 136 aa  59.7  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0156283  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2669  PilT protein-like  32.31 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0691561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2826  PilT protein-like  29.85 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.640016  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0505  PilT protein domain protein  29.46 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1461  PilT protein domain protein  32.33 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1319  PilT protein domain protein  30.53 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0638  PilT protein domain protein  31.82 
 
 		 136 aa  57.8  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0478  virulence-associated protein, putative  31.82 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0091  PilT domain-containing protein  32.33 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0602  PilT protein domain protein  28.03 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.191075  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4731  VagD  30.08 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.761951  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2552  PilT domain-containing protein  31.3 
 
 		 152 aa  57.4  0.00000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.748536  normal  0.0339823 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0983  PilT domain-containing protein  29.37 
 
 		 133 aa  57.4  0.00000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2777  PilT protein domain protein  33.08 
 
 		 134 aa  57.4  0.00000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0286  PilT protein domain protein  32.61 
 
 		 135 aa  57  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.024358  decreased coverage  0.0024847 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3905  PilT domain-containing protein  33.33 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.646522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1904  PilT protein domain protein  30.3 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.101114 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2472  virulence associated protein C  29.55 
 
 		 133 aa  55.5  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00148493  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3320  PilT protein-like  31.62 
 
 		 133 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6878  PilT domain-containing protein  26.81 
 
 		 136 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.425666  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6255  PilT domain-containing protein  29.29 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0358672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0154  PilT domain-containing protein  31.85 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1627  PilT protein domain protein  31.34 
 
 		 136 aa  55.8  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.733144  normal  0.420461 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1337  PilT protein domain protein  31.01 
 
 		 129 aa  55.5  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.1325  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1868  PilT domain-containing protein  31.58 
 
 		 133 aa  55.1  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000212984  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6178  PilT protein, N-terminal  26.32 
 
 		 133 aa  54.3  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.382745  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0442  nitrogen regulatory protein NtrR  31.34 
 
 		 134 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.315733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03915  predicted nucleic acid-binding protein,contains PIN domain  36.08 
 
 		 101 aa  53.5  0.0000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.968864  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1213  virulence associated protein C  30.91 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1771  hypothetical protein  27.41 
 
 		 133 aa  53.1  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0908  PilT domain-containing protein  38.57 
 
 		 129 aa  53.5  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0100677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1183  PilT protein domain protein  34.04 
 
 		 119 aa  53.5  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0138  PilT domain-containing protein  31.39 
 
 		 133 aa  53.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0728  PilT protein domain protein  28.15 
 
 		 132 aa  53.5  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.741529  hitchhiker  0.0000801582 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0898  PilT protein domain protein  29.46 
 
 		 131 aa  53.1  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.185586  normal  0.0272728 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0483  PilT domain-containing protein  32.61 
 
 		 133 aa  52  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0155  PilT protein domain protein  29.5 
 
 		 139 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.538447 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4014  PilT protein domain protein  27.78 
 
 		 137 aa  52  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00102621  hitchhiker  0.000259631 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1433  NtrR protein  30.88 
 
 		 140 aa  51.6  0.000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3729  PilT protein-like  29.55 
 
 		 133 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.294534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2366  PilT protein domain protein  31.11 
 
 		 137 aa  51.2  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2936  PilT domain-containing protein  31.34 
 
 		 130 aa  51.2  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.203821 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1681  PilT protein-like  41.82 
 
 		 136 aa  50.8  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.116331  normal  0.664267 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4589  PilT protein domain protein  30.88 
 
 		 139 aa  50.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000022459  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8106  PilT protein domain protein  29.1 
 
 		 138 aa  50.1  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1127  PilT domain-containing protein  31.88 
 
 		 133 aa  50.1  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.539233 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4147  PilT domain-containing protein  29.85 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.448502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2661  PilT domain-containing protein  30 
 
 		 124 aa  50.1  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3968  PilT domain-containing protein  26.92 
 
 		 135 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.10464  normal  0.34904 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0305  PilT protein domain protein  29.01 
 
 		 128 aa  49.7  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0032427  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3267  plasmid maintenance protein  27.82 
 
 		 132 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1138  PilT domain-containing protein  31.52 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0156  PilT protein domain protein  30.6 
 
 		 134 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3368  plasmid maintenance protein  27.82 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1876  PilT protein domain protein  31.78 
 
 		 129 aa  49.3  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3461  PilT domain-containing protein  26.15 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.999718 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36180  PilT domain-containing protein  29.85 
 
 		 136 aa  48.9  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12568  hypothetical protein  29.84 
 
 		 125 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.724019  normal  0.141761 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0012  PilT protein domain-containing protein  25.74 
 
 		 133 aa  47.4  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.948131 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0058  PilT protein domain protein  28.47 
 
 		 148 aa  47.8  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0017  PilT domain-containing protein  28.99 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.461831  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3558  PilT domain-containing protein  25 
 
 		 128 aa  46.6  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0141  plasmid maintenance protein VagD  28.99 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0701  PilT protein domain protein  25.93 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.528227 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1777  PilT domain-containing protein  31.91 
 
 		 143 aa  45.8  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.406004  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1623  virulence associated protein VagD, putative  30.6 
 
 		 134 aa  44.7  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1382  hypothetical protein  31.3 
 
 		 125 aa  44.7  0.0004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000499389  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1443  PilT domain-containing protein  31.3 
 
 		 125 aa  44.7  0.0004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0125509  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1067  PilT protein domain protein  29.77 
 
 		 134 aa  44.3  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1769  hypothetical protein  25.95 
 
 		 131 aa  43.9  0.0007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3682  PilT domain-containing protein  30.88 
 
 		 134 aa  43.9  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.362926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2468  PilT protein domain protein  28.36 
 
 		 135 aa  43.9  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0500169  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>