36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2343 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2343  PilT domain-containing protein  100 
 
 		 133 aa  270  3e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.487913  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1321  PIN domain protein  45.74 
 
 		 130 aa  126  1.0000000000000001e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.282385  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1380  PilT domain-containing protein  46.4 
 
 		 128 aa  125  2.0000000000000002e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.978498  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12568  hypothetical protein  39.52 
 
 		 125 aa  78.2  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.724019  normal  0.141761 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5766  PilT protein domain protein  32.77 
 
 		 126 aa  73.6  0.0000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.300152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11426  hypothetical protein  34.68 
 
 		 133 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.3127099999999998e-21  normal  0.106237 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2082  PilT protein domain protein  33.94 
 
 		 121 aa  70.1  0.000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.951724  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3135  PilT domain-containing protein  34.43 
 
 		 129 aa  64.3  0.0000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1751  PilT domain-containing protein  34.96 
 
 		 131 aa  62.8  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0754903  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2498  PilT protein domain protein  30.89 
 
 		 136 aa  62.4  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0159803 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3572  PilT protein domain protein  30.83 
 
 		 125 aa  58.5  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1443  PilT domain-containing protein  29.17 
 
 		 125 aa  57  0.00000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0125509  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1382  hypothetical protein  29.17 
 
 		 125 aa  57  0.00000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000499389  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0188  PilT protein domain protein  29.06 
 
 		 125 aa  56.6  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3865  PilT domain-containing protein  30.83 
 
 		 126 aa  54.3  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.870941  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0051  PilT domain-containing protein  30.08 
 
 		 126 aa  54.3  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.330837 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0599  PilT domain-containing protein  32.2 
 
 		 128 aa  50.4  0.000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0505  PilT protein domain protein  31.45 
 
 		 131 aa  49.3  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1526  PilT protein-like  28.69 
 
 		 129 aa  47.4  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000713835  decreased coverage  0.00911334 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4420  PilT protein domain protein  22.76 
 
 		 128 aa  47  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1213  virulence associated protein C  29.84 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4092  PilT domain-containing protein  27.93 
 
 		 121 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4274  PilT protein-like  27.93 
 
 		 121 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3431  PilT domain-containing protein  27.93 
 
 		 121 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1062  PilT protein-like  27.93 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1142  nucleic acid-binding protein  28.83 
 
 		 121 aa  42  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4042  PilT protein domain protein  24.6 
 
 		 184 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.72027 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0681  hypothetical protein  25 
 
 		 127 aa  40.8  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000394475  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0983  PilT domain-containing protein  23.2 
 
 		 133 aa  40.8  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3221  hypothetical protein  31.67 
 
 		 134 aa  40.8  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1067  PilT protein domain protein  27.2 
 
 		 134 aa  40.8  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5884  PilT domain-containing protein  29.63 
 
 		 148 aa  40.4  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.669409 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4062  PilT protein domain protein  21.05 
 
 		 155 aa  40.4  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1325  nucleic acid binding protein  28.23 
 
 		 133 aa  40.4  0.009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.000000000000354508  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1675  PilT domain-containing protein  26.98 
 
 		 128 aa  40.4  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000215959 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0091  PilT protein-like  28.91 
 
 		 144 aa  40  0.01  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>