36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0051 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_0051  PilT domain-containing protein  100 
 
 		 126 aa  261  3e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.330837 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1062  PilT protein-like  52.89 
 
 		 121 aa  115  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4092  PilT domain-containing protein  51.24 
 
 		 121 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4274  PilT protein-like  51.24 
 
 		 121 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3431  PilT domain-containing protein  51.24 
 
 		 121 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2082  PilT protein domain protein  48.76 
 
 		 121 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.951724  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1142  nucleic acid-binding protein  48.76 
 
 		 121 aa  104  5e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1201  PilT protein-like  39.67 
 
 		 121 aa  80.9  0.000000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0955216  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1367  PilT protein-like protein  43.55 
 
 		 126 aa  80.1  0.000000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.381279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0656  nucleic acid binding protein  37.39 
 
 		 126 aa  67  0.00000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.388004  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1389  nucleic acid binding protein  33.64 
 
 		 125 aa  60.8  0.000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0940077  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2659  nucleic acid binding protein  36.29 
 
 		 127 aa  58.9  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.234415  normal  0.629356 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0681  hypothetical protein  38.53 
 
 		 127 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000394475  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1114  nucleic acid binding protein  41.25 
 
 		 100 aa  56.6  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0599  PilT domain-containing protein  35.34 
 
 		 128 aa  54.7  0.0000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2343  PilT domain-containing protein  30.08 
 
 		 133 aa  54.3  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.487913  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5766  PilT protein domain protein  32.76 
 
 		 126 aa  52.8  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.300152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1554  PilT protein domain protein  35.29 
 
 		 125 aa  52  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.19075  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2498  PilT protein domain protein  34.11 
 
 		 136 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0159803 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1380  PilT domain-containing protein  31.25 
 
 		 128 aa  48.9  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.978498  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1321  PIN domain protein  31.25 
 
 		 130 aa  48.9  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.282385  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2106  PilT domain-containing protein  31.09 
 
 		 152 aa  48.5  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.245211  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1663  PilT protein-like  31.19 
 
 		 120 aa  47.4  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0881523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0252  PilT protein-like  30.56 
 
 		 155 aa  46.6  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6219  PilT protein domain protein  28.57 
 
 		 129 aa  44.7  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.314877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3988  PilT protein domain protein  30.71 
 
 		 133 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0532731 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3572  PilT protein domain protein  34.48 
 
 		 125 aa  43.9  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4624  PilT domain-containing protein  30.17 
 
 		 136 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.723585  normal  0.112001 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3865  PilT domain-containing protein  26.67 
 
 		 126 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.870941  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3939  PilT protein domain protein  30.83 
 
 		 133 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2987  PilT protein domain protein  32.77 
 
 		 137 aa  41.2  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6277  PilT protein domain protein  32.09 
 
 		 135 aa  40.4  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.466445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0188  PilT protein domain protein  28.95 
 
 		 125 aa  40.8  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4420  PilT protein domain protein  30.17 
 
 		 128 aa  40.4  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2539  PilT domain-containing protein  30.6 
 
 		 136 aa  40.4  0.009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.948556 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1045  virulence-associated protein, putative  30.33 
 
 		 134 aa  40  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.491192  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>