41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0599 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0599  PilT domain-containing protein  100 
 
 		 128 aa  259  1e-68  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5766  PilT protein domain protein  40.83 
 
 		 126 aa  85.5  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.300152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3865  PilT domain-containing protein  39.5 
 
 		 126 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.870941  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0188  PilT protein domain protein  35.29 
 
 		 125 aa  70.9  0.000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3572  PilT protein domain protein  35.29 
 
 		 125 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1142  nucleic acid-binding protein  38.39 
 
 		 121 aa  63.5  0.0000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2498  PilT protein domain protein  34.65 
 
 		 136 aa  60.8  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0159803 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1062  PilT protein-like  35.96 
 
 		 121 aa  60.5  0.000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2559  hypothetical protein  54.39 
 
 		 76 aa  60.1  0.000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00885096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1321  PIN domain protein  32.23 
 
 		 130 aa  60.1  0.00000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.282385  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1380  PilT domain-containing protein  32.23 
 
 		 128 aa  60.1  0.00000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.978498  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1382  hypothetical protein  38.14 
 
 		 125 aa  58.5  0.00000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000499389  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1443  PilT domain-containing protein  38.14 
 
 		 125 aa  58.5  0.00000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0125509  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4092  PilT domain-containing protein  33.33 
 
 		 121 aa  57  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4274  PilT protein-like  33.33 
 
 		 121 aa  57  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3431  PilT domain-containing protein  33.33 
 
 		 121 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0051  PilT domain-containing protein  35.34 
 
 		 126 aa  54.7  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.330837 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2082  PilT protein domain protein  32.11 
 
 		 121 aa  53.9  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.951724  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11426  hypothetical protein  31.3 
 
 		 133 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.3127099999999998e-21  normal  0.106237 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1086  PilT domain-containing protein  36.47 
 
 		 90 aa  52.4  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.174841  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0038  PilT domain-containing protein  33.08 
 
 		 146 aa  52  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2343  PilT domain-containing protein  32.2 
 
 		 133 aa  50.4  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.487913  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4420  PilT protein domain protein  30.33 
 
 		 128 aa  49.7  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12568  hypothetical protein  30.83 
 
 		 125 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.724019  normal  0.141761 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0656  nucleic acid binding protein  33.04 
 
 		 126 aa  48.1  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.388004  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3135  PilT domain-containing protein  25.6 
 
 		 129 aa  46.2  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1367  PilT protein-like protein  31.62 
 
 		 126 aa  45.1  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.381279  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2987  PilT protein domain protein  34.69 
 
 		 137 aa  44.7  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0679  PilT protein-like  29.92 
 
 		 158 aa  44.3  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000163156  unclonable  0.00000001 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0728  PilT protein domain protein  30.23 
 
 		 132 aa  42.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.741529  hitchhiker  0.0000801582 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4104  PilT protein-like  27.73 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.393493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0091  PilT domain-containing protein  28.1 
 
 		 132 aa  41.6  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4014  PilT protein domain protein  27.13 
 
 		 137 aa  41.2  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00102621  hitchhiker  0.000259631 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0871  putative plasmid stability-like protein  31.75 
 
 		 137 aa  40.8  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.852163  normal  0.0312935 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6219  PilT protein domain protein  30.65 
 
 		 129 aa  40.8  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.314877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4624  PilT domain-containing protein  26.19 
 
 		 136 aa  40.4  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.723585  normal  0.112001 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0152  PilT protein domain protein  29.37 
 
 		 134 aa  40.4  0.007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2127  vapC protein, putative  29.92 
 
 		 133 aa  40.8  0.007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3765  PilT protein domain protein  30 
 
 		 133 aa  40.4  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0857  PilT protein  29.77 
 
 		 140 aa  40.4  0.009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.159356 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0602  PilT protein domain protein  29.92 
 
 		 135 aa  40.4  0.009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.191075  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>