50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6219 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6219  PilT protein domain protein  100 
 
 		 129 aa  257  4e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.314877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2659  nucleic acid binding protein  34.15 
 
 		 127 aa  82.4  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.234415  normal  0.629356 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1389  nucleic acid binding protein  35.65 
 
 		 125 aa  64.3  0.0000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0940077  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1663  PilT protein-like  40.66 
 
 		 120 aa  63.9  0.0000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0881523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1114  nucleic acid binding protein  36.08 
 
 		 100 aa  62.4  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0681  hypothetical protein  36.36 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000394475  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1062  PilT protein-like  37.84 
 
 		 121 aa  57  0.00000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4274  PilT protein-like  31.82 
 
 		 121 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4092  PilT domain-containing protein  31.82 
 
 		 121 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1367  PilT protein-like protein  33.33 
 
 		 126 aa  53.5  0.0000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.381279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0679  PilT protein-like  35.61 
 
 		 158 aa  53.1  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000163156  unclonable  0.00000001 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3431  PilT domain-containing protein  31.82 
 
 		 121 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1142  nucleic acid-binding protein  30.91 
 
 		 121 aa  52.8  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2082  PilT protein domain protein  34.55 
 
 		 121 aa  52.4  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.951724  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0679  putative plasmid stability protein  50.85 
 
 		 145 aa  51.6  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.536522  normal  0.93191 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3131  PilT protein domain protein  29.73 
 
 		 124 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0656  nucleic acid binding protein  32.2 
 
 		 126 aa  51.2  0.000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.388004  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2839  nucleic acid-binding protein contains PIN domain  49.15 
 
 		 140 aa  50.4  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.454124  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0857  PilT protein  50.85 
 
 		 140 aa  50.4  0.000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.159356 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2039  PilT domain-containing protein  33.33 
 
 		 140 aa  50.1  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.837298  normal  0.704455 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1777  PilT domain-containing protein  28.38 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.406004  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3333  PilT domain-containing protein  46.67 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4182  PilT domain-containing protein  46.67 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4833  PilT protein-like  46.67 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0188  PilT protein domain protein  30.08 
 
 		 125 aa  48.1  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3163  PilT protein domain protein  43.75 
 
 		 139 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.732092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3418  PilT protein, N-terminal  49.15 
 
 		 150 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.317439  normal  0.0554428 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1999  PIN domain protein  47.46 
 
 		 150 aa  47  0.00009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0463072  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2647  PilT domain-containing protein  34.21 
 
 		 124 aa  46.2  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.434907  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0505  putative plasmid stability protein  45.31 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.294814 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2534  PilT protein, N-terminal  61.76 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.641844  normal  0.62652 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4565  PilT protein domain protein  50 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0234  PilT domain-containing protein  31.75 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.749646 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0051  PilT domain-containing protein  28.57 
 
 		 126 aa  44.7  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.330837 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1362  plasmid stability protein, putative  41.51 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00298137  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4008  putative PilT-like protein  35.96 
 
 		 163 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5766  PilT protein domain protein  28.46 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.300152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4581  PilT protein-like  30.5 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.766949  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4543  PilT protein domain protein  36.47 
 
 		 136 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3767  PilT domain-containing protein  38.98 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.546918  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1554  PilT protein domain protein  28.7 
 
 		 125 aa  41.2  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.19075  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2498  PilT protein domain protein  30.77 
 
 		 136 aa  41.2  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0159803 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1592  hypothetical protein  58.33 
 
 		 93 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.488215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4014  PilT protein domain protein  38.78 
 
 		 137 aa  41.2  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00102621  hitchhiker  0.000259631 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5055  PilT domain-containing protein  30.4 
 
 		 133 aa  41.2  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0599  PilT domain-containing protein  30.65 
 
 		 128 aa  40.8  0.006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4147  PilT domain-containing protein  29.46 
 
 		 134 aa  40.8  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.448502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2559  hypothetical protein  30.77 
 
 		 76 aa  40.8  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00885096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1213  PilT domain-containing protein  56.76 
 
 		 143 aa  40.8  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.401096 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2934  PilT protein-like  30.63 
 
 		 144 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.119744  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>