39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_4092 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_4092  PilT domain-containing protein  100 
 
 		 121 aa  242  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4274  PilT protein-like  100 
 
 		 121 aa  242  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3431  PilT domain-containing protein  99.17 
 
 		 121 aa  240  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1142  nucleic acid-binding protein  58.68 
 
 		 121 aa  154  5.0000000000000005e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1062  PilT protein-like  57.85 
 
 		 121 aa  147  5e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2082  PilT protein domain protein  50.41 
 
 		 121 aa  135  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.951724  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0051  PilT domain-containing protein  51.24 
 
 		 126 aa  113  7.999999999999999e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.330837 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1201  PilT protein-like  45.45 
 
 		 121 aa  110  9e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0955216  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1367  PilT protein-like protein  41.32 
 
 		 126 aa  93.2  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.381279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2659  nucleic acid binding protein  40.52 
 
 		 127 aa  72  0.000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.234415  normal  0.629356 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0681  hypothetical protein  36.29 
 
 		 127 aa  68.2  0.00000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000394475  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0656  nucleic acid binding protein  37.29 
 
 		 126 aa  63.5  0.0000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.388004  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0599  PilT domain-containing protein  33.33 
 
 		 128 aa  57  0.00000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6219  PilT protein domain protein  31.82 
 
 		 129 aa  53.9  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.314877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1389  nucleic acid binding protein  29.73 
 
 		 125 aa  49.7  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0940077  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1554  PilT protein domain protein  34.02 
 
 		 125 aa  49.7  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.19075  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1321  PIN domain protein  30.89 
 
 		 130 aa  49.3  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.282385  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1380  PilT domain-containing protein  30.89 
 
 		 128 aa  49.3  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.978498  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3131  PilT protein domain protein  33.33 
 
 		 124 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0679  PilT protein-like  30.89 
 
 		 158 aa  47.4  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000163156  unclonable  0.00000001 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5766  PilT protein domain protein  31.67 
 
 		 126 aa  46.6  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.300152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2343  PilT domain-containing protein  27.93 
 
 		 133 aa  45.4  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.487913  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4187  DNA replication protein-like protein  30.58 
 
 		 135 aa  44.7  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.49294 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1382  hypothetical protein  30.97 
 
 		 125 aa  42.7  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000499389  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1443  PilT domain-containing protein  30.97 
 
 		 125 aa  42.7  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0125509  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11426  hypothetical protein  33.62 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.3127099999999998e-21  normal  0.106237 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1114  nucleic acid binding protein  34.62 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4062  PilT protein domain protein  27.03 
 
 		 155 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3572  PilT protein domain protein  30.36 
 
 		 125 aa  42  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1663  PilT protein-like  28.7 
 
 		 120 aa  41.6  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0881523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0252  PilT protein-like  29.09 
 
 		 155 aa  42  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4042  PilT protein domain protein  28.86 
 
 		 184 aa  42  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.72027 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3765  PilT protein domain protein  28.1 
 
 		 133 aa  41.2  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2620  PilT protein domain protein  29.27 
 
 		 134 aa  41.6  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3865  PilT domain-containing protein  26.79 
 
 		 126 aa  41.2  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.870941  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4076  plamid maintenance protein  29.75 
 
 		 135 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4014  PilT protein domain protein  30.16 
 
 		 137 aa  40.4  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00102621  hitchhiker  0.000259631 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3680  PilT protein domain protein  31.78 
 
 		 134 aa  40.4  0.009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1461  PilT protein domain protein  31.78 
 
 		 134 aa  40  0.01  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>