16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1201 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1201  PilT protein-like  100 
 
 		 121 aa  246  7e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0955216  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2082  PilT protein domain protein  51.28 
 
 		 121 aa  118  3e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.951724  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3431  PilT domain-containing protein  45.45 
 
 		 121 aa  110  5e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4274  PilT protein-like  45.45 
 
 		 121 aa  110  9e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4092  PilT domain-containing protein  45.45 
 
 		 121 aa  110  9e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1062  PilT protein-like  46.28 
 
 		 121 aa  105  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1367  PilT protein-like protein  50.77 
 
 		 126 aa  97.8  4e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.381279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1142  nucleic acid-binding protein  39.67 
 
 		 121 aa  89.4  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0051  PilT domain-containing protein  39.67 
 
 		 126 aa  80.9  0.000000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.330837 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2498  PilT protein domain protein  34.21 
 
 		 136 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0159803 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0656  nucleic acid binding protein  34.91 
 
 		 126 aa  52.8  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.388004  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0679  PilT protein-like  32.46 
 
 		 158 aa  51.2  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000163156  unclonable  0.00000001 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2659  nucleic acid binding protein  37.27 
 
 		 127 aa  47.4  0.00006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.234415  normal  0.629356 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5766  PilT protein domain protein  34.13 
 
 		 126 aa  43.5  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.300152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1390  PilT domain-containing protein  36.71 
 
 		 141 aa  42.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0505  putative plasmid stability protein  38.1 
 
 		 145 aa  41.2  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.294814 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>