38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2082 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2082  PilT protein domain protein  100 
 
 		 121 aa  249  1e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.951724  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1142  nucleic acid-binding protein  55.37 
 
 		 121 aa  136  7.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4092  PilT domain-containing protein  50.41 
 
 		 121 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4274  PilT protein-like  50.41 
 
 		 121 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1062  PilT protein-like  56.3 
 
 		 121 aa  134  3.0000000000000003e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3431  PilT domain-containing protein  50.41 
 
 		 121 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1201  PilT protein-like  51.28 
 
 		 121 aa  118  3e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0955216  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0051  PilT domain-containing protein  48.76 
 
 		 126 aa  109  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.330837 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1367  PilT protein-like protein  45.08 
 
 		 126 aa  94.7  4e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.381279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2343  PilT domain-containing protein  33.94 
 
 		 133 aa  70.1  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.487913  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2659  nucleic acid binding protein  38.6 
 
 		 127 aa  68.9  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.234415  normal  0.629356 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1321  PIN domain protein  32.54 
 
 		 130 aa  67.4  0.00000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.282385  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1380  PilT domain-containing protein  32.54 
 
 		 128 aa  67.4  0.00000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.978498  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2498  PilT protein domain protein  36.13 
 
 		 136 aa  64.7  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0159803 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0656  nucleic acid binding protein  33.33 
 
 		 126 aa  60.1  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.388004  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0681  hypothetical protein  37.5 
 
 		 127 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000394475  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0599  PilT domain-containing protein  32.11 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1389  nucleic acid binding protein  32.74 
 
 		 125 aa  53.9  0.0000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0940077  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3572  PilT protein domain protein  28.57 
 
 		 125 aa  53.1  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6219  PilT protein domain protein  34.55 
 
 		 129 aa  52.4  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.314877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5766  PilT protein domain protein  29.75 
 
 		 126 aa  51.6  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.300152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3131  PilT protein domain protein  33.64 
 
 		 124 aa  50.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1114  nucleic acid binding protein  39.74 
 
 		 100 aa  50.1  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0679  PilT protein-like  32.77 
 
 		 158 aa  49.3  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000163156  unclonable  0.00000001 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1443  PilT domain-containing protein  28.83 
 
 		 125 aa  48.5  0.00003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0125509  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1382  hypothetical protein  28.83 
 
 		 125 aa  48.5  0.00003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000499389  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2280  PilT protein domain protein  36.52 
 
 		 134 aa  47.8  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.234231 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1663  PilT protein-like  27.36 
 
 		 120 aa  47  0.00008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0881523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2106  PilT domain-containing protein  33.33 
 
 		 152 aa  46.6  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.245211  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4624  PilT domain-containing protein  30.47 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.723585  normal  0.112001 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0252  PilT protein-like  34.29 
 
 		 155 aa  46.6  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0414  PilT protein domain protein  32.77 
 
 		 135 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2647  PilT domain-containing protein  31.19 
 
 		 124 aa  43.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.434907  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1554  PilT protein domain protein  32.65 
 
 		 125 aa  43.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.19075  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0188  PilT protein domain protein  29.82 
 
 		 125 aa  42.7  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0389  PilT protein domain protein  26.36 
 
 		 126 aa  41.6  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3865  PilT domain-containing protein  24.55 
 
 		 126 aa  41.2  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.870941  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2936  PilT domain-containing protein  28.57 
 
 		 130 aa  40.8  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.203821 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>