23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_2106 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_2106  PilT domain-containing protein  100 
 
 		 152 aa  304  3e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.245211  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0252  PilT protein-like  47.71 
 
 		 155 aa  150  8e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1837  PilT protein-like protein  35.29 
 
 		 153 aa  87  8e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0877816  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2205  PilT protein-like  32.17 
 
 		 150 aa  81.6  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.682603  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3589  PilT protein domain protein  32.82 
 
 		 149 aa  80.5  0.000000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000773088  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2035  PilT domain-containing protein  32.84 
 
 		 151 aa  78.2  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0116997  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0178  PilT protein domain protein  30.66 
 
 		 148 aa  70.5  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.110884 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0621  PilT domain-containing protein  34.35 
 
 		 148 aa  70.1  0.000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0550538 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4646  PilT protein domain protein  34.07 
 
 		 147 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000332576  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0272  PilT protein domain protein  27.94 
 
 		 153 aa  69.7  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000977844  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3324  PilT protein-like  31.3 
 
 		 147 aa  67  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.108302  normal  0.226575 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0658  PilT protein domain protein  33.61 
 
 		 151 aa  65.5  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0680222  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0226  PilT protein-like protein  28.12 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.562188  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3724  PilT protein-like  27.27 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1581  PilT protein domain protein  26.15 
 
 		 138 aa  50.1  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1114  nucleic acid binding protein  31.96 
 
 		 100 aa  49.3  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0051  PilT domain-containing protein  31.09 
 
 		 126 aa  48.5  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.330837 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2082  PilT protein domain protein  33.33 
 
 		 121 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.951724  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0685  PilT protein-like  27.56 
 
 		 153 aa  44.3  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000532303  unclonable  0.00000000804933 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0899  PilT protein-like  32.79 
 
 		 62 aa  42.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1062  PilT protein-like  32.41 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1564  PilT protein domain protein  27.18 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.896252 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3131  PilT protein domain protein  35.23 
 
 		 124 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>