23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0226 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0226  PilT protein-like protein  100 
 
 		 145 aa  296  5e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.562188  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0272  PilT protein domain protein  39.31 
 
 		 153 aa  100  7e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000977844  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2205  PilT protein-like  40.74 
 
 		 150 aa  97.8  4e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.682603  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3589  PilT protein domain protein  39.26 
 
 		 149 aa  97.8  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000773088  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0178  PilT protein domain protein  35.25 
 
 		 148 aa  88.2  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.110884 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1837  PilT protein-like protein  30.43 
 
 		 153 aa  80.1  0.000000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0877816  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3324  PilT protein-like  35.88 
 
 		 147 aa  77.8  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.108302  normal  0.226575 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2035  PilT domain-containing protein  36 
 
 		 151 aa  76.3  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0116997  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0685  PilT protein-like  35.54 
 
 		 153 aa  75.5  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000532303  unclonable  0.00000000804933 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4646  PilT protein domain protein  31.85 
 
 		 147 aa  67.4  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000332576  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0621  PilT domain-containing protein  35.71 
 
 		 148 aa  67.4  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0550538 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2106  PilT domain-containing protein  28.12 
 
 		 152 aa  61.2  0.000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.245211  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1564  PilT protein domain protein  33.81 
 
 		 137 aa  60.1  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.896252 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0658  PilT protein domain protein  29.51 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0680222  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0252  PilT protein-like  33.04 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1581  PilT protein domain protein  28.37 
 
 		 138 aa  52.4  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2468  hypothetical protein  35.64 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0371794  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2498  PilT protein domain protein  25.93 
 
 		 136 aa  47.4  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0159803 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1387  PilT protein-like  25.55 
 
 		 136 aa  45.1  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.325205 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3724  PilT protein-like  23.08 
 
 		 146 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2149  PilT protein-like  23.66 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2721  PilT protein domain protein  27.55 
 
 		 136 aa  42  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0312646  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0599  PilT protein domain protein  28.93 
 
 		 139 aa  41.2  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0000306671  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>