18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1387 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_1387  PilT protein-like  100 
 
 
136 aa  276  5e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.325205 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2149  PilT protein-like  43.94 
 
 
136 aa  127  7.000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2205  PilT protein-like  24.79 
 
 
150 aa  55.5  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.682603  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1837  PilT protein-like protein  26.52 
 
 
153 aa  55.5  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0877816  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3324  PilT protein-like  29.29 
 
 
147 aa  54.7  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.108302  normal  0.226575 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0178  PilT protein domain protein  30.15 
 
 
148 aa  53.9  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.110884 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1307  PilT domain-containing protein  30.15 
 
 
129 aa  52  0.000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.556032  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2551  PilT protein domain protein  48 
 
 
130 aa  48.9  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.959756  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0252  PilT protein-like  32.95 
 
 
155 aa  49.3  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2035  PilT domain-containing protein  23.28 
 
 
151 aa  49.3  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0116997  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2772  PilT protein domain protein  29.63 
 
 
128 aa  48.5  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3724  PilT protein-like  27.59 
 
 
146 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3589  PilT protein domain protein  25.58 
 
 
149 aa  47.8  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000773088  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1564  PilT protein domain protein  25.76 
 
 
137 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.896252 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0226  PilT protein-like protein  25.55 
 
 
145 aa  45.1  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.562188  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0272  PilT protein domain protein  23.97 
 
 
153 aa  44.3  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000977844  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0621  PilT domain-containing protein  30.53 
 
 
148 aa  43.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0550538 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1184  PilT domain-containing protein  32 
 
 
134 aa  40.4  0.007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.681973 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>