24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3724 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3724  PilT protein-like  100 
 
 		 146 aa  300  6.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0178  PilT protein domain protein  39.86 
 
 		 148 aa  89  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.110884 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1837  PilT protein-like protein  36.05 
 
 		 153 aa  88.2  4e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0877816  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0658  PilT protein domain protein  30.77 
 
 		 151 aa  74.7  0.0000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0680222  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2035  PilT domain-containing protein  29.84 
 
 		 151 aa  68.2  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0116997  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0621  PilT domain-containing protein  34.15 
 
 		 148 aa  67.4  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0550538 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0272  PilT protein domain protein  28.36 
 
 		 153 aa  61.6  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000977844  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3531  PilT protein-like  30.92 
 
 		 162 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.17101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3589  PilT protein domain protein  27.05 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000773088  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2106  PilT domain-containing protein  27.27 
 
 		 152 aa  57.8  0.00000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.245211  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3324  PilT protein-like  30 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.108302  normal  0.226575 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4646  PilT protein domain protein  28.99 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000332576  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2205  PilT protein-like  30.08 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.682603  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0252  PilT protein-like  24.62 
 
 		 155 aa  49.7  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1581  PilT protein domain protein  28.8 
 
 		 138 aa  48.9  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1631  PilT domain-containing protein  26.87 
 
 		 148 aa  48.5  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.013688 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1387  PilT protein-like  27.59 
 
 		 136 aa  48.9  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.325205 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3686  PilT domain-containing protein  29.93 
 
 		 153 aa  46.2  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2149  PilT protein-like  30.07 
 
 		 136 aa  45.4  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0226  PilT protein-like protein  23.08 
 
 		 145 aa  44.3  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.562188  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1570  PilT-like protein  27.01 
 
 		 142 aa  44.3  0.0006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00584099  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1821  hypothetical protein  26.5 
 
 		 135 aa  41.2  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2468  hypothetical protein  25.62 
 
 		 147 aa  41.6  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0371794  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4609  hypothetical protein  26.89 
 
 		 137 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.437369 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>