22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1837 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1837  PilT protein-like protein  100 
 
 		 153 aa  313  4e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0877816  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0178  PilT protein domain protein  50 
 
 		 148 aa  159  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.110884 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0272  PilT protein domain protein  38.36 
 
 		 153 aa  100  9e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000977844  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3589  PilT protein domain protein  38.35 
 
 		 149 aa  94  6e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000773088  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2035  PilT domain-containing protein  36.03 
 
 		 151 aa  92  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0116997  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0658  PilT protein domain protein  35.66 
 
 		 151 aa  91.3  5e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0680222  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3531  PilT protein-like  39.6 
 
 		 162 aa  89.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.17101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3724  PilT protein-like  36.05 
 
 		 146 aa  88.2  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0252  PilT protein-like  38.28 
 
 		 155 aa  87  7e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2106  PilT domain-containing protein  35.29 
 
 		 152 aa  87  8e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.245211  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0621  PilT domain-containing protein  29.73 
 
 		 148 aa  85.5  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0550538 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3324  PilT protein-like  31.51 
 
 		 147 aa  82  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.108302  normal  0.226575 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0226  PilT protein-like protein  30.43 
 
 		 145 aa  80.1  0.000000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.562188  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2205  PilT protein-like  32.23 
 
 		 150 aa  76.3  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.682603  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4646  PilT protein domain protein  34.56 
 
 		 147 aa  74.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000332576  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0685  PilT protein-like  38.46 
 
 		 153 aa  67  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000532303  unclonable  0.00000000804933 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1581  PilT protein domain protein  34.06 
 
 		 138 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1387  PilT protein-like  26.52 
 
 		 136 aa  55.5  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.325205 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0899  PilT protein-like  37.93 
 
 		 62 aa  47.4  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2149  PilT protein-like  26.32 
 
 		 136 aa  45.1  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1564  PilT protein domain protein  26.56 
 
 		 137 aa  43.9  0.0007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.896252 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2498  PilT protein domain protein  28.28 
 
 		 136 aa  40.8  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0159803 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>