22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3324 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_3324  PilT protein-like  100 
 
 		 147 aa  293  6e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.108302  normal  0.226575 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2035  PilT domain-containing protein  44.27 
 
 		 151 aa  105  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0116997  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0272  PilT protein domain protein  39.86 
 
 		 153 aa  104  5e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000977844  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3589  PilT protein domain protein  40.74 
 
 		 149 aa  99.8  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000773088  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4646  PilT protein domain protein  39.39 
 
 		 147 aa  99  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000332576  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0178  PilT protein domain protein  39.04 
 
 		 148 aa  88.6  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.110884 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1837  PilT protein-like protein  31.51 
 
 		 153 aa  82  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0877816  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0226  PilT protein-like protein  35.88 
 
 		 145 aa  77.8  0.00000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.562188  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0621  PilT domain-containing protein  36.23 
 
 		 148 aa  74.7  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0550538 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0685  PilT protein-like  38.58 
 
 		 153 aa  74.3  0.0000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000532303  unclonable  0.00000000804933 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0658  PilT protein domain protein  33.1 
 
 		 151 aa  73.9  0.0000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0680222  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2205  PilT protein-like  32.56 
 
 		 150 aa  73.6  0.0000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.682603  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1581  PilT protein domain protein  35.56 
 
 		 138 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2106  PilT domain-containing protein  31.3 
 
 		 152 aa  67  0.00000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.245211  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0252  PilT protein-like  35.65 
 
 		 155 aa  63.2  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1564  PilT protein domain protein  32.06 
 
 		 137 aa  57.4  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.896252 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3724  PilT protein-like  30 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1387  PilT protein-like  29.29 
 
 		 136 aa  54.7  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.325205 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0899  PilT protein-like  40 
 
 		 62 aa  51.2  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2468  hypothetical protein  32.23 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0371794  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2149  PilT protein-like  24.49 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3412  hypothetical protein  30.36 
 
 		 139 aa  40.8  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>