22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1554 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1554  PilT protein domain protein  100 
 
 		 125 aa  254  3e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.19075  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0681  hypothetical protein  46.15 
 
 		 127 aa  94.7  3e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000394475  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3131  PilT protein domain protein  39.83 
 
 		 124 aa  79  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3765  PilT protein domain protein  38.26 
 
 		 133 aa  71.6  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0679  PilT protein-like  36 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000163156  unclonable  0.00000001 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1389  nucleic acid binding protein  32.11 
 
 		 125 aa  52  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0940077  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0051  PilT domain-containing protein  35.29 
 
 		 126 aa  51.6  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.330837 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0857  hypothetical protein  50 
 
 		 54 aa  51.2  0.000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.146235  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2659  nucleic acid binding protein  35.78 
 
 		 127 aa  50.4  0.000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.234415  normal  0.629356 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4274  PilT protein-like  34.02 
 
 		 121 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4092  PilT domain-containing protein  34.02 
 
 		 121 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3431  PilT domain-containing protein  34.02 
 
 		 121 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1663  PilT protein-like  26.92 
 
 		 120 aa  48.9  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0881523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2647  PilT domain-containing protein  36.61 
 
 		 124 aa  48.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.434907  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1114  nucleic acid binding protein  34.15 
 
 		 100 aa  47.8  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1142  nucleic acid-binding protein  30 
 
 		 121 aa  45.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1062  PilT protein-like  32.41 
 
 		 121 aa  45.4  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0656  nucleic acid binding protein  34.91 
 
 		 126 aa  43.9  0.0007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.388004  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6219  PilT protein domain protein  29.06 
 
 		 129 aa  43.9  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.314877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2082  PilT protein domain protein  32.65 
 
 		 121 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.951724  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1367  PilT protein-like protein  29.82 
 
 		 126 aa  41.6  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.381279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0414  PilT protein domain protein  31.82 
 
 		 135 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>